More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2175 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
223 aa  459  1e-128  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  60.83 
 
 
223 aa  272  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  55.5 
 
 
231 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.81506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
222 aa  201  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  5.25729e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
229 aa  183  2e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  43.63 
 
 
239 aa  174  1e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
232 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  43.56 
 
 
231 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  47.24 
 
 
237 aa  164  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
233 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  46.73 
 
 
233 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
225 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
232 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 
232 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
230 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 
235 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 
228 aa  146  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
231 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.18605e-05  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
230 aa  144  7e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
235 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  41.71 
 
 
226 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
235 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
234 aa  139  4e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
229 aa  130  1e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 
226 aa  131  1e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 
229 aa  129  4e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
224 aa  125  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
224 aa  125  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.95575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
239 aa  124  8e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
226 aa  124  8e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
220 aa  124  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
229 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
230 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
250 aa  120  1e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
227 aa  120  2e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
230 aa  119  5e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
227 aa  117  1e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
227 aa  117  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 
221 aa  115  4e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  1.09727e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
256 aa  115  4e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
219 aa  115  4e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  33 
 
 
230 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 
227 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 
215 aa  114  9e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
248 aa  114  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 
216 aa  114  1e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 
223 aa  113  2e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
220 aa  113  2e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
230 aa  114  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
244 aa  112  4e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
229 aa  112  4e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
290 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
241 aa  110  2e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.04 
 
 
239 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 
230 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
262 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
231 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.18 
 
 
263 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
268 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
263 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
227 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 
212 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
226 aa  109  4e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
231 aa  109  4e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 
216 aa  109  4e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
214 aa  109  4e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
227 aa  109  4e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
255 aa  109  4e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
255 aa  109  4e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
230 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
232 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
222 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.51 
 
 
224 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
240 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.98 
 
 
240 aa  108  7e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
228 aa  108  7e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
258 aa  108  8e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
211 aa  108  8e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
255 aa  108  8e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
222 aa  108  8e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
227 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
212 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
255 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
274 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
229 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
234 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
224 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 
227 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
238 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  34.83 
 
 
240 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
239 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
229 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  34.83 
 
 
240 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
233 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
233 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
262 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
262 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
211 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
253 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 
222 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>