More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2136 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  100 
 
 
397 aa  810  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.19259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  69.52 
 
 
399 aa  608  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.13101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  66.5 
 
 
408 aa  562  1e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  1.79563e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  59.6 
 
 
398 aa  519  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  59.8 
 
 
399 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  59.19 
 
 
399 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.59685e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  59.45 
 
 
397 aa  512  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  58.69 
 
 
398 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.54307e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  59.85 
 
 
395 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.37028e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  58.59 
 
 
405 aa  500  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  9.04206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  62.06 
 
 
401 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.22881e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  58.59 
 
 
396 aa  494  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  58.44 
 
 
397 aa  484  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  9.14313e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  57.65 
 
 
397 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  56.31 
 
 
398 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  56.68 
 
 
397 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.29459e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  55.64 
 
 
404 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  55.81 
 
 
398 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  55.81 
 
 
398 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  55.95 
 
 
398 aa  474  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  54.5 
 
 
403 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  56.06 
 
 
398 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  55.89 
 
 
406 aa  461  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  56.39 
 
 
406 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  54.75 
 
 
403 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  56.28 
 
 
401 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  54.66 
 
 
397 aa  453  1e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.14678e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  53.55 
 
 
397 aa  454  1e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  52.87 
 
 
396 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  51.9 
 
 
397 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  51.65 
 
 
397 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  53.02 
 
 
401 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  51.14 
 
 
397 aa  440  1e-122  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  51.14 
 
 
397 aa  439  1e-122  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  51.39 
 
 
397 aa  440  1e-122  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  51.39 
 
 
397 aa  441  1e-122  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  51.39 
 
 
397 aa  441  1e-122  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  53.28 
 
 
404 aa  440  1e-122  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  51.39 
 
 
397 aa  440  1e-122  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  51.39 
 
 
397 aa  440  1e-122  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  51.39 
 
 
397 aa  441  1e-122  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  50.89 
 
 
397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  51.88 
 
 
421 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.41189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  50.48 
 
 
419 aa  425  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  50.63 
 
 
421 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  50.88 
 
 
421 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.52602e-11  hitchhiker  1.92642e-06 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  52.55 
 
 
414 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  50.25 
 
 
398 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  52.72 
 
 
397 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.98382e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  50.51 
 
 
421 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  50.26 
 
 
417 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  8.35714e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  50 
 
 
421 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  51.03 
 
 
420 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  50.5 
 
 
402 aa  416  1e-115  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  51.24 
 
 
402 aa  415  1e-115  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  49.24 
 
 
421 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  48.37 
 
 
421 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.22438e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  52 
 
 
396 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  48.5 
 
 
421 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  46.97 
 
 
417 aa  408  1e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  50.75 
 
 
403 aa  405  1e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  50.25 
 
 
400 aa  407  1e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  50.25 
 
 
400 aa  407  1e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  49.75 
 
 
398 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  49.63 
 
 
404 aa  400  1e-110  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  47.24 
 
 
399 aa  399  1e-110  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  48.66 
 
 
406 aa  398  1e-110  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  47.38 
 
 
402 aa  401  1e-110  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  46.75 
 
 
418 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  47.77 
 
 
401 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  49.26 
 
 
397 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  48.21 
 
 
395 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  48.38 
 
 
397 aa  387  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.5 
 
 
394 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  47.25 
 
 
395 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  49.01 
 
 
401 aa  376  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  47.99 
 
 
397 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  46.77 
 
 
404 aa  376  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  44.84 
 
 
399 aa  375  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  47.24 
 
 
397 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  4.32075e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  45.5 
 
 
452 aa  375  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  3.73865e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  43.83 
 
 
404 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0394  acetate kinase  43.11 
 
 
419 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  46.31 
 
 
422 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  44.08 
 
 
404 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  47.75 
 
 
397 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  44.97 
 
 
396 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  44.7 
 
 
414 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  43.83 
 
 
404 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  44.47 
 
 
394 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  44.97 
 
 
396 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  43.83 
 
 
404 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  43.83 
 
 
404 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  46.75 
 
 
394 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  43.32 
 
 
399 aa  363  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  45.14 
 
 
396 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  44.44 
 
 
404 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  46.12 
 
 
398 aa  362  7e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  44.56 
 
 
400 aa  361  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  44.05 
 
 
399 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.76936e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>