109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2135 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2135  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
165 aa  330  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  6.07383e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1027  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  127  5e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  7.75006e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1258  protein of unknown function DUF177  33.54 
 
 
173 aa  97.1  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.35148e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  29.45 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1976  hypothetical protein  32.73 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  30.12 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.65612e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1328  hypothetical protein  33.93 
 
 
175 aa  90.5  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.16974e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1694  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  87.4  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  34.53 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  34.15 
 
 
161 aa  83.2  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.31873e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10220  predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein  32.93 
 
 
157 aa  82  4e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.30799e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0636  hypothetical protein  26.75 
 
 
172 aa  80.9  7e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  1.12577e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  22.67 
 
 
193 aa  76.3  2e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.48202e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2742  hypothetical protein  36.64 
 
 
186 aa  73.9  8e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0662187  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  27.96 
 
 
186 aa  71.6  4e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  27.96 
 
 
186 aa  71.6  4e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2753  hypothetical protein  27.96 
 
 
186 aa  70.9  8e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2503  hypothetical protein  32.76 
 
 
174 aa  70.5  1e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2071  protein of unknown function DUF177  30.17 
 
 
193 aa  67.4  9e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.972003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1354  protein of unknown function DUF177  31.52 
 
 
183 aa  67.4  9e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.53474e-07  normal  0.152935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1889  protein of unknown function DUF177  40 
 
 
230 aa  65.9  3e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10040  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  34.15 
 
 
183 aa  65.5  3e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.41201e-06  hitchhiker  3.28703e-07 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  31.58 
 
 
179 aa  64.3  7e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4143  hypothetical protein  31.93 
 
 
183 aa  64.3  7e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  26.92 
 
 
185 aa  63.5  1e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2888e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  30.63 
 
 
195 aa  63.9  1e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2295  protein of unknown function DUF177  30.7 
 
 
191 aa  62.8  2e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0450584  hitchhiker  0.00203125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  32.48 
 
 
192 aa  62.4  3e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1368  hypothetical protein  31.13 
 
 
184 aa  62  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000101542  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  32.65 
 
 
179 aa  61.2  6e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.2525e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8019  protein of unknown function DUF177  32.11 
 
 
204 aa  61.2  6e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  26.86 
 
 
179 aa  60.8  7e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.37805e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  28.7 
 
 
184 aa  60.5  1e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  33.06 
 
 
187 aa  60.1  1e-08  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  2.97886e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  59.7  2e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  7.98674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  26.52 
 
 
178 aa  59.7  2e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  3.60622e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0474  hypothetical protein  26.7 
 
 
182 aa  59.3  2e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.4524e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  29.57 
 
 
215 aa  58.9  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  29.51 
 
 
186 aa  59.3  3e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.60952e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3104  protein of unknown function DUF177  40 
 
 
203 aa  58.5  4e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203008 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1411  protein of unknown function DUF177  32.76 
 
 
177 aa  58.5  4e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  30.51 
 
 
182 aa  58.2  5e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.2907e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0835  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  57.8  6e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  6.35204e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0856  protein of unknown function DUF177  27.56 
 
 
189 aa  57.8  7e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  30.58 
 
 
185 aa  57.8  7e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0649  hypothetical protein  27.97 
 
 
202 aa  57  1e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.865201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0210  protein of unknown function DUF177  27.87 
 
 
192 aa  57  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4193  hypothetical protein  29.66 
 
 
196 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1339  protein of unknown function DUF177  29.63 
 
 
167 aa  56.6  1e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.518128  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1512  protein of unknown function DUF177  26.92 
 
 
173 aa  57  1e-07  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1566  protein of unknown function DUF177  27.83 
 
 
194 aa  56.2  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0425556  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1104  protein of unknown function DUF177  28.47 
 
 
187 aa  56.6  2e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.78932e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  26.72 
 
 
187 aa  56.2  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.02797e-06 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1610  protein of unknown function DUF177  27.67 
 
 
192 aa  55.5  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00433257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4025  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  55.8  3e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.64591e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0071  protein of unknown function DUF177  27.59 
 
 
176 aa  55.5  3e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  55.5  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  23.37 
 
 
182 aa  55.8  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.801895 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1847  hypothetical protein  26.57 
 
 
178 aa  55.1  4e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1928  hypothetical protein  26.89 
 
 
189 aa  55.1  4e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1994  hypothetical protein  26.89 
 
 
189 aa  55.1  4e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  0.358979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1948  hypothetical protein  26.89 
 
 
189 aa  55.1  4e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  30.28 
 
 
185 aa  55.1  5e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0339  hypothetical protein  28.04 
 
 
216 aa  54.7  5e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.834637  normal  0.0667006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12941  hypothetical protein  29.2 
 
 
207 aa  54.3  6e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1284  hypothetical protein  26.72 
 
 
187 aa  54.7  6e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  30.85 
 
 
175 aa  54.3  7e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.68903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  26.67 
 
 
178 aa  54.3  7e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1942  protein of unknown function DUF177  31.19 
 
 
180 aa  54.3  8e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.2056e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3683  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  53.5  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.98265e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3977  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.34808e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3775  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.922e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4063  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  7.2434e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3939  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1216  hypothetical protein  24.1 
 
 
166 aa  53.5  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.47083e-10  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3970  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000472322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3666  hypothetical protein  24.7 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.58031e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11270  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  28.21 
 
 
191 aa  52.8  2e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  28.72 
 
 
182 aa  53.1  2e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  25.83 
 
 
185 aa  52.8  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2426  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  52.8  2e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00706179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2275  protein of unknown function DUF177  26.5 
 
 
184 aa  52.8  2e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1039  putative metal-binding/nucleic acid-binding protein  28.07 
 
 
209 aa  52.4  3e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10850  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  27.59 
 
 
187 aa  52.4  3e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00522306  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1136  hypothetical protein  29.67 
 
 
194 aa  52.4  3e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103256  normal  0.0238581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  27.97 
 
 
185 aa  52  3e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1598  hypothetical protein  35.29 
 
 
179 aa  52  4e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08880  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  24.52 
 
 
190 aa  52  4e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.486062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2574  hypothetical protein  26.63 
 
 
166 aa  51.6  4e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.36342e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3693  protein of unknown function DUF177  28.57 
 
 
171 aa  51.2  6e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7997  metal-binding possibly nucleic acid-binding protein-like protein  25.93 
 
 
184 aa  50.8  8e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0656  hypothetical protein  29.31 
 
 
159 aa  50.4  9e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1057  hypothetical protein  28.17 
 
 
139 aa  50.1  1e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  2.25436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2558  protein of unknown function DUF177  27.88 
 
 
179 aa  50.4  1e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1274  hypothetical protein  29.14 
 
 
147 aa  50.4  1e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000334048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1739  hypothetical protein  31.43 
 
 
180 aa  49.7  2e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000472305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2170  hypothetical protein  26.5 
 
 
197 aa  49.7  2e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1085  metal-binding protein  28.48 
 
 
147 aa  49.7  2e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3751  hypothetical protein  25.75 
 
 
166 aa  49.7  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  3.23099e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1607  protein of unknown function DUF177  23.73 
 
 
192 aa  49.3  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0562637  normal  0.911119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>