161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2123 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  100 
 
 
425 aa  869    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  70.93 
 
 
415 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6460  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  51.52 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6169  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  50.15 
 
 
342 aa  348  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  51.17 
 
 
476 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2125  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  48.4 
 
 
364 aa  330  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.825854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  46.3 
 
 
514 aa  295  8e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  44.65 
 
 
507 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  44.65 
 
 
507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6329  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40 
 
 
386 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6029  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40 
 
 
390 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0780998  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1555  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.32 
 
 
612 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1617  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.32 
 
 
606 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0588913  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4875  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.35 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3290  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.35 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.7 
 
 
619 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0917  glycosy hydrolase family protein  35.65 
 
 
400 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3886  glycosy hydrolase family protein  35.65 
 
 
400 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.371175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0972  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.65 
 
 
400 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1279  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.98 
 
 
399 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000518384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04100  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.44 
 
 
557 aa  203  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2961  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.49 
 
 
405 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00892323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1159  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.09 
 
 
373 aa  200  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0601771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1318  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.8 
 
 
405 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03928  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  52.69 
 
 
181 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04110  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.7 
 
 
399 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2047  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.79 
 
 
377 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074716  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03980  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.01 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1066  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.9 
 
 
412 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.980933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3080  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.15 
 
 
777 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0385  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.27 
 
 
732 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.677811  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.91 
 
 
916 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05727  Endo-beta-1,4-galactanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS6]  31.92 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0903691  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2256  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.99 
 
 
391 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.020335 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1003  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.7 
 
 
897 aa  143  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.629221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0683  sigma-70 factor  30.25 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481968  hitchhiker  0.000000266294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.19 
 
 
492 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1334  glycosyl hydrolase 53 protein  32.5 
 
 
480 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2827  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.22 
 
 
650 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000305574  hitchhiker  0.00171331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  48.81 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  51.95 
 
 
471 aa  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  41.75 
 
 
707 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
535 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  37.61 
 
 
820 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.65 
 
 
831 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  37.17 
 
 
311 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  47.06 
 
 
532 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  45.45 
 
 
630 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  40.51 
 
 
621 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  35.77 
 
 
780 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  44.78 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.25 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
660 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.89 
 
 
790 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 
649 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 
814 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.12 
 
 
582 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  51.56 
 
 
961 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 
308 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  46.77 
 
 
571 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  42.17 
 
 
848 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.66 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  38.94 
 
 
316 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  41.25 
 
 
590 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.86 
 
 
537 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
591 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  40.85 
 
 
736 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03929  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.18 
 
 
77 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 
619 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  37.63 
 
 
725 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  40.28 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  41.43 
 
 
477 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  46.27 
 
 
490 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  39.36 
 
 
554 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  44.62 
 
 
524 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
1077 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  39.24 
 
 
509 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
710 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  40.79 
 
 
710 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  39.47 
 
 
298 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 
739 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  44.29 
 
 
951 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  45.57 
 
 
870 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.93 
 
 
567 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  40.85 
 
 
563 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 
773 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  43.42 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 
536 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  38.46 
 
 
600 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.18 
 
 
411 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.93 
 
 
324 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  39.13 
 
 
679 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  38.46 
 
 
746 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  45.31 
 
 
949 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  28.45 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  41.03 
 
 
563 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  37.68 
 
 
955 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  41.67 
 
 
873 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  39.44 
 
 
539 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>