More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2115 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 432 aa  896    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  39.44 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 495 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 448 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.18 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  22.94 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.5 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  21.38 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  20.17 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  21.3 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  23.41 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.62 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.12 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  21.07 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.42 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.38 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.43 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  21.12 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  21 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.25 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  19.32 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.55 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  21.1 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.03 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>