More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2082 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  48.37 
 
 		 221 aa  207  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  42.2 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  39.91 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  38.25 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  38.18 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  37.79 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  37.27 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  37.79 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  38.73 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  37.61 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  34.7 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  36.82 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  35.32 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  34.6 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  38.36 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  36.45 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  33.49 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  34.56 
 
 		 249 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  30.92 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  34.72 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.95 
 
 		 443 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  35.36 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  31.34 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  32.11 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  30.8 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  31.8 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  31.05 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  31.68 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  33.85 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 		 299 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  31.78 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  31.8 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  32.08 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  35.07 
 
 		 450 aa  121  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  36.87 
 
 		 450 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  34.33 
 
 		 449 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  29.95 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  32 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  32.73 
 
 		 452 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  34.23 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  31.28 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  32.87 
 
 		 445 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  33.95 
 
 		 444 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  31.48 
 
 		 448 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  30.69 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  26.94 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 454 aa  108  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  30.09 
 
 		 454 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  31.48 
 
 		 448 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.76 
 
 		 459 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 454 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  29.33 
 
 		 458 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  29.7 
 
 		 445 aa  104  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 		 457 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  32.34 
 
 		 449 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  31.71 
 
 		 449 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  32.06 
 
 		 445 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 		 448 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 450 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.41 
 
 		 457 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 444 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  27.43 
 
 		 458 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  35.11 
 
 		 446 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32 
 
 		 628 aa  99.8  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 445 aa  99.4  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 		 449 aa  99  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  30.45 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  27.56 
 
 		 458 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  99  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  27.56 
 
 		 458 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  27.56 
 
 		 458 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  31.02 
 
 		 437 aa  98.6  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  98.2  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 		 445 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  27.65 
 
 		 465 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.37 
 
 		 626 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  28.92 
 
 		 469 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>