207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2080 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  100 
 
 
447 aa  880  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.61963e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  47.65 
 
 
447 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.06231e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  44.47 
 
 
446 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.54787e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  47.39 
 
 
446 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  47.17 
 
 
446 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  44.72 
 
 
445 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  44.07 
 
 
443 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  44.47 
 
 
444 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.8325e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  44.27 
 
 
450 aa  343  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  41.7 
 
 
446 aa  337  3e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.13719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  43.6 
 
 
446 aa  337  3e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.91225e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  43.34 
 
 
443 aa  322  9e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.78363e-12  decreased coverage  8.77762e-18 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  42.38 
 
 
458 aa  319  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  40.62 
 
 
441 aa  315  1e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  39.87 
 
 
451 aa  309  7e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  42.44 
 
 
449 aa  309  8e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.17077e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  39.15 
 
 
447 aa  306  5e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  38.39 
 
 
447 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  38.39 
 
 
447 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  38.7 
 
 
447 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  38.26 
 
 
447 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  38.26 
 
 
447 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  38.26 
 
 
447 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  37.95 
 
 
447 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.22 
 
 
455 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.97091e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  37.81 
 
 
447 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  37.81 
 
 
447 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  37.81 
 
 
447 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.88 
 
 
417 aa  289  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  41.35 
 
 
456 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.48 
 
 
454 aa  283  6e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.79 
 
 
430 aa  282  7e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.42 
 
 
442 aa  275  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.55 
 
 
447 aa  275  1e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  37.42 
 
 
443 aa  273  4e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.69 
 
 
458 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  38.53 
 
 
457 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.29525e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  38.6 
 
 
445 aa  266  6e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  41.61 
 
 
471 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.33945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  39.42 
 
 
439 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  36.63 
 
 
454 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.66 
 
 
449 aa  259  5e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  39.19 
 
 
455 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.02 
 
 
452 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  36.4 
 
 
454 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  35.36 
 
 
454 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  36.24 
 
 
449 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  35.36 
 
 
454 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  35.81 
 
 
453 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  40 
 
 
455 aa  255  1e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.01 
 
 
453 aa  254  2e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  39.35 
 
 
453 aa  254  2e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.76 
 
 
616 aa  254  2e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  36.1 
 
 
455 aa  254  2e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0806e-09 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  34.16 
 
 
432 aa  253  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  34.68 
 
 
441 aa  253  7e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  37.5 
 
 
439 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  37.5 
 
 
439 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  37.72 
 
 
439 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  40.22 
 
 
454 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  39.33 
 
 
443 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  35.36 
 
 
453 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.22698e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  40.22 
 
 
454 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  35.36 
 
 
453 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.78373e-07 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  35.59 
 
 
458 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  37.28 
 
 
439 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  34.91 
 
 
453 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  37.28 
 
 
439 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  37.28 
 
 
439 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  35.79 
 
 
454 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  35.14 
 
 
453 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.93 
 
 
456 aa  249  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  34.81 
 
 
467 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.85 
 
 
458 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  38.01 
 
 
447 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  36.26 
 
 
439 aa  248  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  37.28 
 
 
439 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  37.5 
 
 
439 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.69 
 
 
479 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  37.05 
 
 
439 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  36.55 
 
 
444 aa  246  5e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  38.14 
 
 
422 aa  246  5e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  38.59 
 
 
454 aa  244  2e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  36.85 
 
 
431 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.87 
 
 
446 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  38 
 
 
444 aa  243  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  39.33 
 
 
443 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  35.59 
 
 
453 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.43033e-06 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  38.62 
 
 
447 aa  239  6e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.5 
 
 
435 aa  239  6e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.5 
 
 
435 aa  239  6e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  37.56 
 
 
420 aa  239  7e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  34.86 
 
 
586 aa  239  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3269  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.62 
 
 
456 aa  235  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.724123  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  35.04 
 
 
443 aa  235  1e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.68 
 
 
443 aa  233  4e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  34.2 
 
 
586 aa  233  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  35.54 
 
 
469 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1780  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.63 
 
 
453 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223329  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  35.25 
 
 
443 aa  230  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>