13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2078 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2078  Coat F domain protein  100 
 
 
89 aa  181  4e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.95082e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1976  Coat F domain protein  52.27 
 
 
93 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1935  coat F domain-containing protein  40.79 
 
 
148 aa  64.3  5e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0923  coat F domain-containing protein  31.25 
 
 
91 aa  60.8  5e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1782  coat F domain-containing protein  37.8 
 
 
114 aa  55.8  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3609  Coat F domain protein  40.3 
 
 
105 aa  54.3  6e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0519572  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3092  Coat F domain protein  26.44 
 
 
111 aa  52.8  1e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0546  coat F domain-containing protein  33.33 
 
 
103 aa  50.4  8e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1243  Coat F domain protein  36.49 
 
 
184 aa  47.8  5e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0671007  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2941  Coat F domain protein  28.74 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02260  hypothetical protein  32.18 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.773373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2096  coat F domain-containing protein  29.87 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0641  coat F domain-containing protein  31.08 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>