More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2059 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  82 
 
 		 151 aa  266  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  64.67 
 
 		 158 aa  217  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  59.74 
 
 		 153 aa  207  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  58.82 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  59.33 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  56.29 
 
 		 151 aa  190  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  57.05 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  57.05 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  53.64 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  55.19 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  55.26 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 150 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 150 aa  183  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 150 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 150 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  55.26 
 
 		 153 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  50.65 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  50.65 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  50.65 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  53.74 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  51.3 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.63 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  56.29 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  53.33 
 
 		 176 aa  167  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  52 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 156 aa  163  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 159 aa  163  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 148 aa  163  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 154 aa  163  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  45.58 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 179 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 179 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 174 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  48.98 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  48.68 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  50.34 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  52.94 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  52.94 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  51.7 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>