211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2052 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
102 aa  206  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  65 
 
 
104 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.84 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.84 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.28 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  40.2 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.14 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  46.48 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  40.62 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.22 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.93 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.18 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.93 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  47.83 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.25 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.31 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.26 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.03 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  35.87 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.26 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.37 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  33.65 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.98 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.04 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.29 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.65 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  42.65 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.13 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  39.47 
 
 
114 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.78 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.78 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.78 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.68 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.56 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.33 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.56 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  33.71 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.96 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.56 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  37.04 
 
 
104 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.56 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.56 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.78 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.67 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.67 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.26 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.67 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  38.67 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  38.67 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  38.67 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
110 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.54 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.62 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  35.58 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  36.49 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.74 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.37 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.19 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.84 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.26 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  32.99 
 
 
104 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.49 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  37.21 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.96 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.62 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.25 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  38.57 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  31.73 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  37.84 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.84 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  33.77 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.66 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2673  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.06 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>