221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2039 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
328 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  64.63 
 
 
328 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  57.76 
 
 
329 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  44.48 
 
 
325 aa  328  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  47.27 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  44.98 
 
 
333 aa  322  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  42.38 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  42.24 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  41.77 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  42.51 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  41.59 
 
 
334 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  41.8 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  37.92 
 
 
334 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  40.43 
 
 
323 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  41.41 
 
 
352 aa  264  2e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  39.69 
 
 
335 aa  256  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  38.34 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  35.58 
 
 
334 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  37.31 
 
 
329 aa  235  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  35.74 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  36.45 
 
 
330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  38.2 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  39.06 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  39.06 
 
 
328 aa  222  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  35 
 
 
359 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  31.83 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  34.44 
 
 
363 aa  210  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  33.53 
 
 
366 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  37.2 
 
 
329 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 
359 aa  205  9e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 
359 aa  205  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 
359 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  32.83 
 
 
367 aa  204  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  32.02 
 
 
363 aa  203  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  32.27 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  32.73 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  32.52 
 
 
353 aa  195  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 
326 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  30.65 
 
 
326 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  29.54 
 
 
334 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  29.18 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 
326 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  28.66 
 
 
336 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  26.87 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  29.63 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  26.99 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 
325 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
334 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  31.15 
 
 
326 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  27.86 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  31 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  27.3 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  26.28 
 
 
354 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.37 
 
 
326 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  27.63 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  26.91 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  25.76 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  27.89 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  26.77 
 
 
322 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 
329 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  27.88 
 
 
395 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  27.58 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 
332 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
334 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
334 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
334 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
343 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  28.9 
 
 
320 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  26.83 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  25.47 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.3 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  26.46 
 
 
322 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
332 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  26.14 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>