More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2026 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  100 
 
 
148 aa  290  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  60 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  42.65 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  46.38 
 
 
155 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.78 
 
 
183 aa  120  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  42.45 
 
 
178 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  37.78 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  39.73 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  40.98 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.93 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  37.5 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  39.26 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  38.19 
 
 
178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  38.19 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.43 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  38.96 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.24 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.71 
 
 
162 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  37.24 
 
 
157 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.24 
 
 
171 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  39.42 
 
 
183 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.24 
 
 
177 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.24 
 
 
171 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.71 
 
 
162 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.24 
 
 
177 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  38.19 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  42.96 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.97 
 
 
171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  39.26 
 
 
175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  39.26 
 
 
175 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  38.52 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  36.69 
 
 
161 aa  105  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  36.81 
 
 
164 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.23 
 
 
163 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  36.43 
 
 
157 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.57 
 
 
163 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.78 
 
 
164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  37.41 
 
 
161 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  38.81 
 
 
163 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.97 
 
 
162 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.59 
 
 
167 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.52 
 
 
163 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.52 
 
 
163 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  37.23 
 
 
163 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  40.31 
 
 
166 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  40 
 
 
194 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.04 
 
 
160 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  39.2 
 
 
158 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  36.23 
 
 
164 aa  103  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  37.14 
 
 
167 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  39.29 
 
 
169 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  37.96 
 
 
162 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.69 
 
 
158 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  38.57 
 
 
167 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  38.57 
 
 
167 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  38.57 
 
 
167 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  38.57 
 
 
167 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  38.57 
 
 
167 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.97 
 
 
164 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.14 
 
 
158 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  41.04 
 
 
163 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  37.23 
 
 
162 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  37.6 
 
 
158 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  39.29 
 
 
194 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  39.29 
 
 
194 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  38.57 
 
 
164 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  38.24 
 
 
218 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  36.3 
 
 
164 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.56 
 
 
163 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  38.64 
 
 
163 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.67 
 
 
154 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  36.43 
 
 
163 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  36.36 
 
 
173 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  37.5 
 
 
174 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35 
 
 
167 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  34.31 
 
 
164 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  37.32 
 
 
185 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  36.03 
 
 
165 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  36.76 
 
 
165 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.85 
 
 
159 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  36.76 
 
 
165 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  39.86 
 
 
165 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  34.97 
 
 
174 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.78 
 
 
164 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  37.14 
 
 
163 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>