More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1981 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  100 
 
 
455 aa  895  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.19259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  39.69 
 
 
458 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  39.47 
 
 
458 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  38.44 
 
 
456 aa  303  3e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  36.48 
 
 
453 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  35.43 
 
 
460 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  32.35 
 
 
445 aa  255  9e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  9.18772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  31.87 
 
 
461 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
445 aa  242  9e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  32.14 
 
 
463 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  32.14 
 
 
463 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  31.05 
 
 
479 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  32.13 
 
 
458 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
453 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.62958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  30.11 
 
 
458 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  30.84 
 
 
458 aa  198  1e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
450 aa  198  1e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  29.2 
 
 
459 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  28.73 
 
 
460 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  24.22 
 
 
461 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
484 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.92336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
454 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  22.42 
 
 
461 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
449 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
469 aa  126  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.82 
 
 
454 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
453 aa  115  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.76954e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
463 aa  115  2e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.72 
 
 
442 aa  112  2e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.74233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  24.48 
 
 
439 aa  107  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
469 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
456 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.80901e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  23.23 
 
 
472 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
518 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  23.14 
 
 
461 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
450 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  23.18 
 
 
450 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.82 
 
 
454 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  21.85 
 
 
484 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.3845e-09  hitchhiker  3.34983e-05 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.61 
 
 
438 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.53 
 
 
475 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  1.56724e-11  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  21.85 
 
 
546 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.64 
 
 
467 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  21.41 
 
 
495 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.39345e-07  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.11 
 
 
485 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.18 
 
 
464 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  21.63 
 
 
546 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.0697e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  21.63 
 
 
495 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.35228e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  21.63 
 
 
547 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
452 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
462 aa  99.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  3.17216e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  21.63 
 
 
547 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.95 
 
 
450 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.67 
 
 
451 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
464 aa  97.8  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  21.19 
 
 
484 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.99298e-08  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
451 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  30.67 
 
 
461 aa  97.1  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
486 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  25.64 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  6.27796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.31388e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.71 
 
 
525 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.29 
 
 
464 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
448 aa  94  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.66798e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  20.67 
 
 
456 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  22.12 
 
 
439 aa  93.6  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  22.17 
 
 
469 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  19.05 
 
 
464 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.18 
 
 
468 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.02645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  25.15 
 
 
467 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  24 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.58 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.44 
 
 
461 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.39 
 
 
446 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.81 
 
 
446 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.92 
 
 
464 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.17655e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.62 
 
 
463 aa  92.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.92 
 
 
464 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  9.23462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
458 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  22.84 
 
 
470 aa  90.5  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  23.79 
 
 
447 aa  90.5  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.68 
 
 
464 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.4435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
464 aa  90.1  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.60081e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
464 aa  90.1  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  6.55029e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.68 
 
 
464 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.25629e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.05 
 
 
463 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.44 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  23.33 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  24.68 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  22.63 
 
 
500 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.45 
 
 
449 aa  87.4  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  22.22 
 
 
446 aa  87.4  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  23.44 
 
 
468 aa  85.9  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  21.99 
 
 
462 aa  85.9  1e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.01 
 
 
470 aa  85.9  1e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
470 aa  86.3  1e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.11 
 
 
499 aa  86.3  1e-15  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>