More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1963 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  56.13 
 
 		 157 aa  190  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  39.07 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.06 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  38.41 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  38.41 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  38.41 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  35.26 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.66 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  36.67 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  37.66 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 174 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  38.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  33.94 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  33.94 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  33.94 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  33.94 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>