More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1918 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  52.16 
 
 		 232 aa  258  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  47.19 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  44.78 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  46.52 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  44.25 
 
 		 227 aa  206  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  36.09 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  40.61 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0632  ABC transporter related  45.37 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  40 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  43.11 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  34.78 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  34.93 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  35.4 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  33.79 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  34.35 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2234  ABC transporter related  38.86 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  33.62 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 284 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  34.88 
 
 		 299 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  34.23 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.2 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  34.72 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  32.13 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  34.58 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 341 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  31.33 
 
 		 340 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0794  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  33.94 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  32.3 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  34.68 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  35.68 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  30.18 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  34.03 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 282 aa  138  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 308 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  30.3 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  33.49 
 
 		 299 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  29.31 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  31.56 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  32.72 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  30.77 
 
 		 316 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  31.51 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  31.05 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  32.74 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2003  ABC transporter  34.76 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  32.72 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.86 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.4 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  31.42 
 
 		 297 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  31.86 
 
 		 300 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  32.91 
 
 		 257 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  32.74 
 
 		 309 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  33.8 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  32.16 
 
 		 296 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  32.86 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  27.31 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  32.57 
 
 		 299 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  30.47 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  37.22 
 
 		 287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  30.14 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  31.51 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 306 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  30.47 
 
 		 302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0349  ABC transporter related  32.91 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  29.49 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  31.51 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  31.96 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  31.96 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  31.96 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  30.63 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  30.97 
 
 		 309 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 293 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 283 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 		 293 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  31.39 
 
 		 286 aa  131  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  29.02 
 
 		 287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  30.94 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  31.36 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  32.26 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  29.02 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>