61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1916 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  100 
 
 
331 aa  674    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  57.81 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  47.87 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  45.45 
 
 
332 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  45.6 
 
 
337 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  46.39 
 
 
322 aa  294  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  46.38 
 
 
350 aa  289  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  44.95 
 
 
316 aa  285  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  44.59 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  40.89 
 
 
313 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  45.58 
 
 
322 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  40.74 
 
 
361 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  42.68 
 
 
307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  40.62 
 
 
334 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  40.71 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  41.03 
 
 
308 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  41.03 
 
 
308 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  41.18 
 
 
308 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  41.18 
 
 
308 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  41.18 
 
 
308 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  41.34 
 
 
294 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  41.18 
 
 
308 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  41.18 
 
 
308 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  40.38 
 
 
308 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  41.21 
 
 
308 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  40.93 
 
 
294 aa  248  8e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  40.38 
 
 
308 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  39.6 
 
 
323 aa  245  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  41.45 
 
 
306 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  38.41 
 
 
313 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  33 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  28.12 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  28.14 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  29.25 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.68 
 
 
551 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.67 
 
 
496 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  27.66 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  28.92 
 
 
552 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.21 
 
 
509 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27 
 
 
515 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  30.64 
 
 
509 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  30.64 
 
 
537 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.67 
 
 
590 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.05 
 
 
515 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  25.8 
 
 
540 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28 
 
 
565 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  28.49 
 
 
546 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  27.16 
 
 
545 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  28.83 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.66 
 
 
584 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.45 
 
 
538 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  29.63 
 
 
588 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.98 
 
 
605 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.45 
 
 
538 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  27.45 
 
 
579 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.44 
 
 
602 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.44 
 
 
602 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  27.61 
 
 
539 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  27.85 
 
 
579 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1765  putative chaperone  30.08 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20570  putative chaperone  30.08 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.157015  normal  0.858478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>