More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1873 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  100 
 
 		 130 aa  248  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  44.34 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  43.55 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  45.08 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  38.58 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.71 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  39.68 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  39.34 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  38.33 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.39 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  42.4 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  47.31 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  40.16 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.8 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  44.9 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  37.1 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  48.86 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.47 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  44.76 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  41.6 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  37.04 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  39.6 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  45 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  34.68 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.58 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  36.89 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  36.63 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  41.58 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  39.64 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  40.65 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  39.64 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.61 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  35.59 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.93 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  42.24 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  39.83 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  34.96 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  34.71 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>