27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1866 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  80.19 
 
 		 212 aa  347  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  54.38 
 
 		 334 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  53.95 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  54.63 
 
 		 494 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  61.71 
 
 		 338 aa  208  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  61.11 
 
 		 338 aa  207  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  53 
 
 		 428 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  60.89 
 
 		 380 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  54.41 
 
 		 1001 aa  202  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  56.78 
 
 		 343 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  60.23 
 
 		 692 aa  201  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  58.56 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  58.33 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  59.34 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  59.12 
 
 		 767 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  44.34 
 
 		 411 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  44.39 
 
 		 1160 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  42.79 
 
 		 524 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  44.14 
 
 		 357 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  49.46 
 
 		 356 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  46.07 
 
 		 683 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  42.24 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  35.89 
 
 		 337 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  41.06 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  30.81 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  29.21 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>