More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1849 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  100 
 
 		 413 aa  855    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  39.75 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  30.52 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  29.87 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.42 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.46 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  29.76 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.52 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.32 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.35 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.26 
 
 		 363 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.4 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.4 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.72 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.48 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.92 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  28.96 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30.21 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.68 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.18 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.74 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.93 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.79 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.69 
 
 		 369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.59 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.56 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.87 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.29 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.18 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.27 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.73 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.04 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.03 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.22 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.33 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.49 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.65 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.14 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.27 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.21 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.25 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.75 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  25.55 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.19 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  24 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.75 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  24.17 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.68 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  24.17 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.68 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.68 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.17 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.47 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.92 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25.38 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  31.73 
 
 		 201 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  31.28 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  24.38 
 
 		 460 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.59 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  24.09 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.03 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.48 
 
 		 371 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  22.73 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.37 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  26.42 
 
 		 487 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.54 
 
 		 392 aa  99.8  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25.12 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  22.49 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  22.52 
 
 		 463 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  25.07 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.62 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  25.6 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  23.01 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.37 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  25.23 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.86 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  29.63 
 
 		 438 aa  93.2  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.07 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.7 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.59 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  27.12 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  22.71 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6234  regulatory protein GntR HTH  24.11 
 
 		 514 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.34 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>