96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1831 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  32.64 
 
 
362 aa  124  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  33.16 
 
 
373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  34.04 
 
 
337 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  32.47 
 
 
369 aa  99.4  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  30.93 
 
 
574 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  32.39 
 
 
577 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  34.83 
 
 
1046 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  31.37 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  29.44 
 
 
329 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  25.38 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  26.52 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  34.33 
 
 
328 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  31.45 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  27.93 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  30.46 
 
 
484 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  27.93 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  25.99 
 
 
365 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  32.68 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07115  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010047  normal  0.501365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  25 
 
 
359 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  31.4 
 
 
388 aa  62.4  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  28.48 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  29.65 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  27.74 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  29.5 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  27.74 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  24.29 
 
 
359 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  26.29 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  26.29 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  29.81 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0671  RelA/SpoT domain protein  31.25 
 
 
329 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  29.88 
 
 
216 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  28.1 
 
 
224 aa  58.2  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  28.4 
 
 
212 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  28.16 
 
 
239 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  27.22 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  26.63 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  30.22 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  27.95 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  27.22 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  28.48 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  28 
 
 
296 aa  55.5  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1321  RelA/SpoT domain-containing protein  29.71 
 
 
423 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000180036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  29.71 
 
 
423 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000281443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  25.83 
 
 
230 aa  55.1  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  27.22 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  27.22 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  27.22 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  26.14 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  27.96 
 
 
570 aa  54.7  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  26.58 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  26.58 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  26.58 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  29.68 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  26.58 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  28.37 
 
 
313 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  30.43 
 
 
246 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  28.57 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  24.29 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  22.56 
 
 
368 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  29.03 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  22.56 
 
 
368 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  26.59 
 
 
349 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  27.17 
 
 
268 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  27.17 
 
 
268 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  29.69 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  24.86 
 
 
272 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  31.16 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  24.85 
 
 
223 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  27.45 
 
 
247 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  27.7 
 
 
274 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  25.87 
 
 
256 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  24.1 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  26.92 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  27.61 
 
 
233 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  26.74 
 
 
716 aa  45.1  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  23.64 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  25.62 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  26.32 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  26.32 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  26.09 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11397  hypothetical protein  26.72 
 
 
273 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2275  hypothetical protein  25.16 
 
 
266 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.08442  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  28.08 
 
 
277 aa  42  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  26.19 
 
 
542 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  26.89 
 
 
353 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>