More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1799 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  60.13 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  47.67 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  48.73 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  45.83 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  45.7 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  46.76 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  46.34 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  46.36 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  46.05 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  47.34 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  46.36 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  46.47 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  46.36 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  46.36 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.82 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  39.13 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 239 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  31.72 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  38.04 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  41.56 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  40.26 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  44.37 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  37.65 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.84 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.9 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  39.22 
 
 		 223 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  37.91 
 
 		 246 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  37.42 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  37.8 
 
 		 286 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  42.28 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  38.2 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.67 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.67 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  38.3 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  37.33 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  35.98 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.6 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  39.57 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  39.35 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  35.68 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  39.46 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  35.76 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.55 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  31.05 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.16 
 
 		 282 aa  94.7  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  35.79 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  30.68 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  34.39 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.33 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  36.84 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  36.54 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.34 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  36.18 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  37.65 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  33.33 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  37.4 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  36.36 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  35.57 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.62 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  33.52 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.59 
 
 		 260 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  33.52 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.96 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  35.57 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  33.75 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.94 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  36.84 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.94 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  32.14 
 
 		 265 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  31.69 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>