More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1779 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  60.67 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  49.17 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  51.3 
 
 		 323 aa  318  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  47.37 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  49.33 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  46.75 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  48.34 
 
 		 310 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  45.72 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  50.5 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  49.33 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  49.5 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  45.64 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  46.82 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  47.7 
 
 		 409 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  45.9 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  45.85 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  46.56 
 
 		 318 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  52.46 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  47.68 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  46.38 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  46.73 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 334 aa  285  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  45.75 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  46.56 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  47.7 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  46.71 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  47.7 
 
 		 309 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  48.01 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  48.34 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  46.53 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  50.18 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  49.33 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  46.33 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  46.13 
 
 		 321 aa  281  7.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  46.03 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  45.69 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  45.69 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  45.69 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  45.69 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  45.69 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  45.69 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  45.69 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  47.35 
 
 		 318 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  45.69 
 
 		 318 aa  279  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  44.85 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  46.91 
 
 		 318 aa  278  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 361 aa  278  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  45.75 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  45.72 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  46 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  44.67 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  45.37 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.48 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  46.89 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  43.93 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  45.07 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  46.86 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  46 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  49.83 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  45.81 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  45.51 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  43.65 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  45.07 
 
 		 332 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  44.63 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  45.72 
 
 		 396 aa  272  6e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  43.89 
 
 		 333 aa  271  9e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  46.53 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  44.33 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  44.19 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  45.13 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  47.06 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  44.33 
 
 		 306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  45 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  45 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  43.89 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  46.69 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  44.33 
 
 		 306 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  44.48 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  45.07 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  44.04 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  47.21 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  44.92 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  44.26 
 
 		 327 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>