More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1774 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  100 
 
 
1248 aa  2576    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.69 
 
 
1241 aa  916    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.47 
 
 
1241 aa  915    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  40.16 
 
 
1241 aa  912    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  49.21 
 
 
1233 aa  1172    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.24 
 
 
1241 aa  912    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.16 
 
 
1241 aa  910    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.08 
 
 
1240 aa  912    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  38.82 
 
 
1242 aa  856    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  40.96 
 
 
1241 aa  919    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  40.16 
 
 
1241 aa  912    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.31 
 
 
1405 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  40.93 
 
 
1242 aa  932    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  41.77 
 
 
1244 aa  994    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  40.19 
 
 
1230 aa  931    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  40.5 
 
 
1244 aa  887    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  47.42 
 
 
1271 aa  1108    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  47.22 
 
 
1270 aa  1107    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.39 
 
 
1241 aa  916    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  58.13 
 
 
1251 aa  1477    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  38.64 
 
 
1236 aa  843    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  34.04 
 
 
1392 aa  743    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  36.01 
 
 
1377 aa  775    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  33.28 
 
 
1282 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.55 
 
 
1241 aa  912    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  33.18 
 
 
1217 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  33.18 
 
 
1217 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  32.22 
 
 
1218 aa  619  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  31.85 
 
 
1204 aa  572  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.26 
 
 
1230 aa  519  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.92 
 
 
1186 aa  504  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  28.32 
 
 
1240 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  29.61 
 
 
1121 aa  458  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  29.69 
 
 
1207 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  30.06 
 
 
1392 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.23 
 
 
1203 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.96 
 
 
1217 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  23.45 
 
 
1184 aa  236  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  24.12 
 
 
1057 aa  206  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 
1161 aa  181  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  28.4 
 
 
1226 aa  176  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  23.9 
 
 
1061 aa  173  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 
1165 aa  170  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 
1149 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.59 
 
 
1262 aa  157  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  23.43 
 
 
1177 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  22.65 
 
 
1125 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 
1173 aa  148  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 
1123 aa  147  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 
1147 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  23.98 
 
 
1162 aa  147  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  23.56 
 
 
1124 aa  146  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  22.41 
 
 
1110 aa  146  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 
1080 aa  145  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.68 
 
 
1224 aa  144  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  23.95 
 
 
1189 aa  144  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  21.27 
 
 
1087 aa  144  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 
1173 aa  144  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  24.46 
 
 
1130 aa  143  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  23.06 
 
 
1110 aa  142  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  24.07 
 
 
1182 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.05 
 
 
1155 aa  140  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.59 
 
 
1177 aa  140  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  22.03 
 
 
1185 aa  139  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 
1196 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  25.16 
 
 
1089 aa  139  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  22.18 
 
 
1156 aa  139  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 
1164 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.52 
 
 
1119 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.47 
 
 
1139 aa  138  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  27 
 
 
1185 aa  137  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 
854 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  21.65 
 
 
1161 aa  136  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 
1120 aa  135  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.09 
 
 
732 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  23.6 
 
 
1121 aa  135  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  22.82 
 
 
1187 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  27.6 
 
 
1183 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  22.74 
 
 
1173 aa  134  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.68 
 
 
860 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 
1065 aa  131  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 
1161 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 
1117 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  26.9 
 
 
1183 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.39 
 
 
1251 aa  129  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.2 
 
 
1226 aa  128  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.7 
 
 
1197 aa  127  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  22.26 
 
 
1140 aa  127  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  26.73 
 
 
1151 aa  126  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.79 
 
 
1115 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  25.42 
 
 
1180 aa  124  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.3 
 
 
1089 aa  124  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  24.72 
 
 
1134 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  24.52 
 
 
833 aa  124  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 
1165 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  23.78 
 
 
1164 aa  122  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  24.4 
 
 
1124 aa  122  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  25.13 
 
 
1180 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  22.31 
 
 
1118 aa  121  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.69 
 
 
1209 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>