288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1759 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  64.83 
 
 
541 aa  761    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  100 
 
 
543 aa  1116    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  54.34 
 
 
540 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  47.92 
 
 
525 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.62 
 
 
536 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  51.06 
 
 
470 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50 
 
 
525 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  51.06 
 
 
469 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.03 
 
 
530 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  48.64 
 
 
524 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 
544 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  46.36 
 
 
570 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  47.64 
 
 
522 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  45.61 
 
 
547 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 
535 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.89 
 
 
474 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  45.34 
 
 
536 aa  445  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  44.38 
 
 
535 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  47.56 
 
 
467 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  42.66 
 
 
531 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.01 
 
 
470 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  43.31 
 
 
463 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  43.55 
 
 
468 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  43.7 
 
 
536 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  43.67 
 
 
536 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.66 
 
 
469 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  44.56 
 
 
515 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  43.78 
 
 
468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  43.74 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.49 
 
 
468 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  43.13 
 
 
467 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  42.71 
 
 
467 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  44.51 
 
 
469 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.61 
 
 
455 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  40.51 
 
 
476 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  41.61 
 
 
462 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  44.86 
 
 
540 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.31 
 
 
462 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.31 
 
 
462 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 
478 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  40.56 
 
 
464 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.33 
 
 
471 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  42.92 
 
 
464 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  44.74 
 
 
542 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.01 
 
 
532 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  41.31 
 
 
478 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.96 
 
 
465 aa  375  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 
467 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  43.58 
 
 
466 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 
465 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.63 
 
 
480 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.63 
 
 
480 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  41.77 
 
 
460 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.63 
 
 
480 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  40.81 
 
 
480 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.81 
 
 
480 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  39.96 
 
 
465 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.35 
 
 
480 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  39.4 
 
 
464 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
468 aa  368  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.77 
 
 
466 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 
460 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.27 
 
 
490 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  42.21 
 
 
489 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.89 
 
 
481 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.31 
 
 
490 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.48 
 
 
460 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 
462 aa  360  4e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  39.19 
 
 
464 aa  360  4e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40 
 
 
464 aa  359  8e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  39.45 
 
 
461 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  41.53 
 
 
478 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  42.54 
 
 
533 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 
452 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  40.56 
 
 
470 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.22 
 
 
466 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.85 
 
 
467 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.03 
 
 
465 aa  353  5e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  41.01 
 
 
453 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 
467 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  39.61 
 
 
452 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 
452 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  40.7 
 
 
465 aa  350  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 
484 aa  350  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  40.04 
 
 
465 aa  349  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  39.84 
 
 
532 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  39.16 
 
 
454 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  40.04 
 
 
476 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
455 aa  346  8e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  41.14 
 
 
465 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 
454 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 
454 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  38.58 
 
 
535 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  39.7 
 
 
454 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  39.7 
 
 
454 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  40.3 
 
 
452 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 
525 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  39.7 
 
 
452 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 
547 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>