More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1756 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  70.6 
 
 
433 aa  644  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
432 aa  885  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  62.5 
 
 
432 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  62.96 
 
 
433 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  62.96 
 
 
433 aa  583  1e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  61.57 
 
 
433 aa  575  1e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  60.65 
 
 
432 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  59.07 
 
 
430 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  59.03 
 
 
433 aa  553  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  58.84 
 
 
431 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  60.14 
 
 
433 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  60.38 
 
 
438 aa  540  1e-152  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  58.97 
 
 
433 aa  539  1e-152  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  58.37 
 
 
432 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 
432 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  58.14 
 
 
432 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  56.35 
 
 
437 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.25462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  57.94 
 
 
433 aa  518  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  56.74 
 
 
434 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  55.71 
 
 
433 aa  515  1e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  56.54 
 
 
436 aa  515  1e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  55.48 
 
 
433 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  55.71 
 
 
433 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  59.3 
 
 
432 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  55.45 
 
 
441 aa  506  1e-142  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  56.05 
 
 
432 aa  508  1e-142  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  54.65 
 
 
436 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  54.88 
 
 
433 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  54.29 
 
 
432 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  53.85 
 
 
435 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  55.66 
 
 
434 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  54.42 
 
 
433 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  55.09 
 
 
432 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  54.76 
 
 
435 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  55.66 
 
 
433 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  53.5 
 
 
434 aa  493  1e-138  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  54.88 
 
 
433 aa  493  1e-138  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  54.88 
 
 
434 aa  494  1e-138  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  54.97 
 
 
433 aa  494  1e-138  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  56.35 
 
 
433 aa  491  1e-138  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  54.29 
 
 
433 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  52.2 
 
 
433 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  54.31 
 
 
435 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  53.23 
 
 
434 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  52.78 
 
 
435 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  53.69 
 
 
434 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  53.36 
 
 
439 aa  478  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  52.9 
 
 
434 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  52.31 
 
 
433 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  52.66 
 
 
434 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  53.5 
 
 
435 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  51.27 
 
 
435 aa  472  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  52.33 
 
 
439 aa  465  1e-130  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  52.56 
 
 
439 aa  466  1e-130  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  53.02 
 
 
439 aa  467  1e-130  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  51.27 
 
 
433 aa  465  1e-130  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  51.74 
 
 
457 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  50.35 
 
 
446 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 
444 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  51.17 
 
 
444 aa  458  1e-128  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  51.88 
 
 
444 aa  459  1e-128  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  51.16 
 
 
432 aa  453  1e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  51.4 
 
 
428 aa  454  1e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  52.49 
 
 
445 aa  452  1e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  52.61 
 
 
423 aa  446  1e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  48.26 
 
 
436 aa  446  1e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  51.91 
 
 
444 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  51.76 
 
 
433 aa  439  1e-122  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  49.42 
 
 
434 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  47.78 
 
 
434 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  48.96 
 
 
435 aa  434  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  48.03 
 
 
443 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  50.59 
 
 
436 aa  433  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
437 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 
434 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 
439 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
433 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  50.71 
 
 
441 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
441 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
437 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  50.24 
 
 
441 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
434 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  48.95 
 
 
434 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
437 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
437 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  48.24 
 
 
434 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  49.07 
 
 
448 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  50.71 
 
 
446 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  47.89 
 
 
432 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  49.65 
 
 
431 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  48.94 
 
 
434 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  48.01 
 
 
450 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  47.89 
 
 
432 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  47.65 
 
 
434 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  47.89 
 
 
432 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
431 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  47.76 
 
 
437 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
439 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  49.07 
 
 
436 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  48.12 
 
 
432 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>