60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1741 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  100 
 
 
188 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  59.68 
 
 
188 aa  236  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  47.7 
 
 
191 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  45.45 
 
 
185 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  43.48 
 
 
182 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  46.07 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  41.3 
 
 
188 aa  154  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  40.78 
 
 
211 aa  154  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  39.89 
 
 
190 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  39.89 
 
 
190 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  39.89 
 
 
190 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  39.89 
 
 
190 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  39.89 
 
 
190 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  39.89 
 
 
190 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  39.89 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  39.36 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  39.08 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.36 
 
 
190 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  43.09 
 
 
187 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  42.86 
 
 
190 aa  148  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  38.83 
 
 
190 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  39.36 
 
 
190 aa  147  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  37.04 
 
 
195 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  43.85 
 
 
187 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  43.85 
 
 
187 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  38.76 
 
 
196 aa  141  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  38.25 
 
 
200 aa  140  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  37.93 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  38.92 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  40.11 
 
 
235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  38.25 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  36.07 
 
 
192 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  42.86 
 
 
243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  44.93 
 
 
194 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  35.52 
 
 
1128 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  35.59 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  38.32 
 
 
195 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  37.97 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  33.67 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  35.23 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  34.66 
 
 
183 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  35.14 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  34.34 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  34.07 
 
 
196 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  37.33 
 
 
201 aa  101  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  27.49 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  39.73 
 
 
191 aa  51.6  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
190 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  27.08 
 
 
475 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  38.64 
 
 
314 aa  45.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  26.76 
 
 
271 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  29.66 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  26.97 
 
 
247 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  35.06 
 
 
184 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  26.52 
 
 
271 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.21 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2026  Fmu (Sun) domain protein  40.98 
 
 
447 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>