38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1718 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1718  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 		 634 aa  1278    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000557029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1937  copper amine oxidase domain protein  21.85 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  29.45 
 
 		 320 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  30.19 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  30.63 
 
 		 282 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  25.95 
 
 		 481 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  26.13 
 
 		 175 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  26.21 
 
 		 451 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  27.59 
 
 		 289 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.83 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  28.95 
 
 		 732 aa  50.8  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  25.45 
 
 		 792 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  30.3 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  26.45 
 
 		 758 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  29.87 
 
 		 948 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  27.43 
 
 		 591 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  26.13 
 
 		 474 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 704 aa  47.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  30.86 
 
 		 269 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  33.88 
 
 		 746 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  26.89 
 
 		 414 aa  47.4  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  24.11 
 
 		 1305 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  26.74 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  27.05 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  24.48 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  26.02 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.01 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  27.91 
 
 		 535 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  29.63 
 
 		 262 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  25.44 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  23.21 
 
 		 652 aa  45.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  29.41 
 
 		 876 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1762  hypothetical protein  25.22 
 
 		 621 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00346887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  23.15 
 
 		 549 aa  44.3  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 480 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  25.47 
 
 		 456 aa  43.9  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  27.08 
 
 		 269 aa  43.9  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>