More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1708 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  77.01 
 
 		 87 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  73.56 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  71.95 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  71.76 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  74.39 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  71.95 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  69.51 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  66.27 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  65.52 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  66.27 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  65.06 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  66.28 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  65.88 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  70.73 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  65.06 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  62.65 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  63.1 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  62.65 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  61.45 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  67.07 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  64.63 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  61.45 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  60 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3881  ribosomal protein S15  61.73 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>