More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1654 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
330 aa  671  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.34006e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  66.87 
 
 
330 aa  451  1e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  60.58 
 
 
330 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.55402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.29 
 
 
328 aa  357  1e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.79914e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.68 
 
 
450 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  4.15693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.38 
 
 
450 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.42279e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.82 
 
 
329 aa  265  8e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  36.94 
 
 
302 aa  179  6e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  36.1 
 
 
302 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 
320 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.31 
 
 
302 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  34.18 
 
 
295 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.1 
 
 
302 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  35.47 
 
 
302 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  34.28 
 
 
296 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  34.62 
 
 
306 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  32.36 
 
 
301 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
296 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  35 
 
 
310 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
317 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 
296 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
296 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 
296 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 
296 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 
296 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 
296 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 
296 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 
296 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.7 
 
 
298 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.23 
 
 
295 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.69 
 
 
300 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  32.08 
 
 
305 aa  156  5e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.43659e-07  unclonable  2.74126e-08 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.3 
 
 
291 aa  156  5e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.39 
 
 
298 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 
313 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 
299 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  32.8 
 
 
304 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  33.97 
 
 
302 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 
310 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  36.74 
 
 
300 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  32.81 
 
 
302 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.27 
 
 
298 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  32.69 
 
 
324 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  33.12 
 
 
295 aa  154  3e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.09 
 
 
302 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
299 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  33.23 
 
 
298 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  34.09 
 
 
294 aa  152  6e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.38339e-06  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  34.29 
 
 
294 aa  152  6e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  33.12 
 
 
326 aa  152  6e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.35 
 
 
300 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  32.93 
 
 
316 aa  152  9e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.96 
 
 
296 aa  152  9e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  31.11 
 
 
304 aa  152  9e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 
300 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  32.18 
 
 
332 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  32.05 
 
 
291 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 
300 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  35.12 
 
 
304 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 
300 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 
300 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 
300 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.66 
 
 
311 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  31.48 
 
 
298 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 
293 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.69064e-10 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  38.89 
 
 
294 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  30.67 
 
 
308 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  2.55834e-08 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 
307 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  33.44 
 
 
293 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.22 
 
 
311 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  33.23 
 
 
299 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  29.66 
 
 
373 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  31.92 
 
 
295 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.65 
 
 
296 aa  148  1e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  31.89 
 
 
310 aa  148  1e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 
319 aa  148  1e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.67 
 
 
303 aa  148  2e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.67 
 
 
303 aa  148  2e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.67 
 
 
303 aa  148  2e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0117  tyrosine recombinase XerC  33.23 
 
 
316 aa  147  2e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.63 
 
 
308 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
295 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.48 
 
 
298 aa  146  4e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  30.84 
 
 
306 aa  146  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  28.08 
 
 
336 aa  146  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  28.89 
 
 
317 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 
298 aa  145  7e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 
298 aa  145  7e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.23 
 
 
298 aa  145  7e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 
298 aa  145  7e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 
298 aa  145  7e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 
298 aa  145  7e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 
298 aa  145  7e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.48 
 
 
311 aa  145  8e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 
306 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 
298 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  28.3 
 
 
317 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  33.23 
 
 
304 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>