More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1646 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 617 aa  1259    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  24.96 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  30.81 
 
 		 600 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  35.27 
 
 		 610 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 576 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 585 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 600 aa  157  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  30.13 
 
 		 578 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  29.76 
 
 		 603 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 578 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  27.98 
 
 		 627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  25.13 
 
 		 567 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  24.59 
 
 		 594 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  29.38 
 
 		 596 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  24.13 
 
 		 597 aa  140  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  32.17 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  28.43 
 
 		 604 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  23.44 
 
 		 597 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  28.61 
 
 		 574 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  28.41 
 
 		 612 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  28.85 
 
 		 623 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  22.99 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  30.33 
 
 		 488 aa  132  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 502 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 583 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  28.36 
 
 		 574 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  22.59 
 
 		 589 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.6 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  27.11 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  29.97 
 
 		 335 aa  126  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  31.65 
 
 		 569 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  27.54 
 
 		 577 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 495 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  36.15 
 
 		 568 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  28 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  28.47 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  28.21 
 
 		 595 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  34.63 
 
 		 391 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  25.88 
 
 		 512 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 578 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  31.88 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  32.86 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 411 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  30.05 
 
 		 607 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 410 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  27.54 
 
 		 573 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  34.93 
 
 		 600 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 483 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  25.6 
 
 		 594 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  30.92 
 
 		 400 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  25.34 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 426 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  27.43 
 
 		 394 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  30.48 
 
 		 363 aa  108  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  35.06 
 
 		 586 aa  107  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 410 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  29.01 
 
 		 409 aa  107  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  30.19 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  30.19 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  30.19 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  30.19 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0214  histidine kinase internal region  25.06 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  28.63 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0208  histidine kinase internal region  25.06 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 		 398 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  29.81 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  30.66 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  30.57 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 		 408 aa  105  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  29.81 
 
 		 589 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  24.13 
 
 		 394 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.77 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  28.14 
 
 		 403 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 405 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  28.14 
 
 		 403 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  28.14 
 
 		 403 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  23.04 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  29.91 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 645 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 367 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  27.4 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  29.26 
 
 		 465 aa  101  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 557 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 557 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 574 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 557 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  28.63 
 
 		 397 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.92 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 450 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>