More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1643 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  100 
 
 
320 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.13624e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  48.87 
 
 
334 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  49.36 
 
 
334 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  48.87 
 
 
334 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  48.86 
 
 
835 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  48.72 
 
 
325 aa  274  1e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  49.51 
 
 
310 aa  274  2e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  49.18 
 
 
310 aa  272  5e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
311 aa  268  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
311 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  47.9 
 
 
311 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  47.9 
 
 
311 aa  268  9e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
311 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
311 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  47.57 
 
 
311 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  47.57 
 
 
311 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  47.57 
 
 
311 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  47.57 
 
 
311 aa  266  3e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  47.25 
 
 
311 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 
342 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  49.82 
 
 
342 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  49.47 
 
 
334 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  51.76 
 
 
334 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  46.2 
 
 
324 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  46.58 
 
 
350 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  45.91 
 
 
322 aa  254  1e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  46.33 
 
 
324 aa  253  4e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  50.88 
 
 
345 aa  251  8e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  45.4 
 
 
327 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  50.53 
 
 
338 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  44.24 
 
 
327 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  46.91 
 
 
310 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  48.56 
 
 
324 aa  249  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  43.6 
 
 
331 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  45.9 
 
 
311 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  44.06 
 
 
322 aa  248  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  47.71 
 
 
314 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  44.88 
 
 
328 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  50.36 
 
 
308 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  46.33 
 
 
318 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  45.72 
 
 
310 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  46.88 
 
 
323 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  45.76 
 
 
313 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  50.5 
 
 
325 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  41.28 
 
 
306 aa  240  3e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  45.99 
 
 
322 aa  239  3e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  48.67 
 
 
342 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  43.75 
 
 
322 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  42.95 
 
 
333 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  43.08 
 
 
342 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  44.8 
 
 
327 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  43.08 
 
 
342 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.97 
 
 
336 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  43.08 
 
 
342 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  45.87 
 
 
348 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  43.21 
 
 
321 aa  233  2e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  7.74907e-07 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  44.18 
 
 
312 aa  233  4e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  42.68 
 
 
322 aa  233  4e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  42.33 
 
 
314 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.14 
 
 
330 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.14 
 
 
330 aa  231  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.14 
 
 
330 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  43.85 
 
 
321 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  43.85 
 
 
321 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  43.85 
 
 
321 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  43.85 
 
 
321 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  43.85 
 
 
321 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 
321 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  44 
 
 
341 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  44.73 
 
 
315 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
332 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  43.65 
 
 
298 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  43.65 
 
 
294 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  43.65 
 
 
294 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  40.67 
 
 
383 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.56 
 
 
346 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  43.93 
 
 
279 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  42.54 
 
 
331 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 
346 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
346 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  42.35 
 
 
309 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  41.01 
 
 
322 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
336 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.19 
 
 
333 aa  223  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  40.82 
 
 
343 aa  221  1e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  40.89 
 
 
345 aa  221  1e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  42.77 
 
 
365 aa  220  2e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  40.51 
 
 
343 aa  220  2e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 
309 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  40.78 
 
 
350 aa  219  4e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  41.18 
 
 
342 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 
342 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>