More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1499 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
744 aa  1529    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  41.68 
 
 
743 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  39.53 
 
 
787 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  35.18 
 
 
697 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  35.24 
 
 
657 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  35.07 
 
 
656 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  34.75 
 
 
653 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  34.3 
 
 
639 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  34.66 
 
 
656 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  32.06 
 
 
725 aa  316  8e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  34.94 
 
 
634 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  34.96 
 
 
665 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 
698 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  30.83 
 
 
680 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  31.66 
 
 
671 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  28.86 
 
 
1085 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  31.85 
 
 
682 aa  281  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  31.41 
 
 
689 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  30.78 
 
 
697 aa  276  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  29.11 
 
 
788 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  31.05 
 
 
687 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  44.21 
 
 
652 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  47.39 
 
 
619 aa  256  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  29.91 
 
 
749 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  41.08 
 
 
662 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  34.38 
 
 
1193 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  31.36 
 
 
646 aa  230  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  44.57 
 
 
450 aa  221  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  45.14 
 
 
432 aa  221  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  43.8 
 
 
450 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  44.31 
 
 
448 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  45.95 
 
 
478 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  45.45 
 
 
444 aa  211  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  43.41 
 
 
450 aa  210  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  41.86 
 
 
466 aa  210  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  43.97 
 
 
441 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  44.67 
 
 
450 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  42.62 
 
 
442 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  41.31 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  39.69 
 
 
434 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  41.86 
 
 
445 aa  197  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  34.72 
 
 
622 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  41.05 
 
 
478 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  35 
 
 
725 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  40.93 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  34.07 
 
 
678 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  39.09 
 
 
299 aa  154  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  55.91 
 
 
134 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  37.84 
 
 
352 aa  145  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.47 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  36.51 
 
 
305 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  34.91 
 
 
387 aa  134  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  37.07 
 
 
443 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 
577 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  32.78 
 
 
580 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  36.57 
 
 
228 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.93 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.4 
 
 
569 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 
617 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.27 
 
 
718 aa  108  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  26.08 
 
 
775 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  27.75 
 
 
570 aa  107  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  27.75 
 
 
570 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  27.75 
 
 
570 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  42.95 
 
 
367 aa  105  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  25.44 
 
 
789 aa  105  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.18 
 
 
754 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.72 
 
 
754 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  35.35 
 
 
739 aa  103  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.27 
 
 
754 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  32.09 
 
 
405 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  32.83 
 
 
639 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.22 
 
 
743 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  38.19 
 
 
789 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.26 
 
 
781 aa  100  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  34.33 
 
 
771 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.94 
 
 
784 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.71 
 
 
742 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.36 
 
 
723 aa  100  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.85 
 
 
740 aa  100  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.2 
 
 
800 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  37.95 
 
 
360 aa  100  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.37 
 
 
391 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  38.13 
 
 
686 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  36.73 
 
 
459 aa  99.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  38.85 
 
 
795 aa  99  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.05 
 
 
801 aa  99  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.36 
 
 
754 aa  98.6  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  30.77 
 
 
613 aa  98.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.71 
 
 
742 aa  98.2  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  38.52 
 
 
772 aa  98.2  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.41 
 
 
781 aa  97.8  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  25.32 
 
 
698 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  37.14 
 
 
771 aa  97.8  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.88 
 
 
757 aa  97.4  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.98 
 
 
759 aa  97.4  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  37.86 
 
 
773 aa  97.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  37.86 
 
 
773 aa  97.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.28 
 
 
806 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  36.61 
 
 
746 aa  96.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>