More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1447 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  100 
 
 
424 aa  872  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  54.63 
 
 
428 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  48.82 
 
 
429 aa  407  1e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  44.42 
 
 
432 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  43.62 
 
 
441 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  43.57 
 
 
424 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  42.56 
 
 
440 aa  343  3e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  43.62 
 
 
441 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  43.79 
 
 
429 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  42.59 
 
 
459 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  42.66 
 
 
431 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  40.51 
 
 
437 aa  320  2e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.04 
 
 
427 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.47 
 
 
466 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  38.19 
 
 
431 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37.91 
 
 
431 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  40.5 
 
 
437 aa  285  8e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  40.48 
 
 
425 aa  285  2e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.37 
 
 
433 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  38.14 
 
 
433 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  38.14 
 
 
433 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  38.14 
 
 
433 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  37.91 
 
 
433 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  37.91 
 
 
433 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.14 
 
 
433 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  38.44 
 
 
424 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  40.19 
 
 
443 aa  275  1e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  39.25 
 
 
433 aa  275  1e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.91 
 
 
433 aa  273  5e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  38.23 
 
 
431 aa  273  5e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 
433 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.44 
 
 
433 aa  270  3e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.32 
 
 
424 aa  270  3e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  38.05 
 
 
425 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.08 
 
 
427 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.83 
 
 
424 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  35.79 
 
 
447 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  37.04 
 
 
416 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 
426 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  35.29 
 
 
465 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 
438 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  34.19 
 
 
435 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.85 
 
 
434 aa  255  1e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.74021e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  37.16 
 
 
427 aa  252  7e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 
453 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  37.22 
 
 
457 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  36.76 
 
 
418 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  35.59 
 
 
451 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  34 
 
 
454 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  36.76 
 
 
418 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 
424 aa  244  1e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  35.86 
 
 
438 aa  245  1e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  34.83 
 
 
437 aa  242  8e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 
425 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.36 
 
 
439 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  37.78 
 
 
416 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.87 
 
 
422 aa  236  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 
432 aa  236  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
425 aa  236  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  36.76 
 
 
413 aa  235  9e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 
437 aa  234  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 
435 aa  234  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  33.63 
 
 
878 aa  232  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  35.73 
 
 
432 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  35.96 
 
 
381 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
438 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  34.04 
 
 
440 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.98 
 
 
420 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  35.73 
 
 
420 aa  227  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  32.85 
 
 
422 aa  226  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  34.12 
 
 
435 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  35.15 
 
 
412 aa  224  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  35.89 
 
 
407 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  37.32 
 
 
414 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  32.65 
 
 
813 aa  222  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  35.7 
 
 
438 aa  222  1e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
463 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  33.09 
 
 
461 aa  216  6e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  32.49 
 
 
404 aa  216  8e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  34.37 
 
 
382 aa  215  1e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.73 
 
 
421 aa  215  1e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  29.88 
 
 
543 aa  215  1e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  39.1 
 
 
423 aa  214  3e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  39.1 
 
 
423 aa  214  3e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  32.77 
 
 
474 aa  213  3e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.65 
 
 
428 aa  213  4e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  31.4 
 
 
422 aa  213  4e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.76883e-07  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  35.93 
 
 
515 aa  213  6e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  31.65 
 
 
428 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
430 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  32.32 
 
 
436 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  33.89 
 
 
442 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
404 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  35.35 
 
 
433 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  31.02 
 
 
485 aa  209  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0455  folylpolyglutamate synthase  34.28 
 
 
393 aa  209  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
452 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  29.53 
 
 
810 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  33.57 
 
 
442 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  30.72 
 
 
847 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>