89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1439 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  42.07 
 
 
811 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  41.75 
 
 
813 aa  661    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  41.31 
 
 
811 aa  649    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  41.75 
 
 
813 aa  661    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  46.27 
 
 
785 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  41.12 
 
 
815 aa  647    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  42.2 
 
 
811 aa  669    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  46.28 
 
 
790 aa  723    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  41.03 
 
 
811 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  54.19 
 
 
784 aa  861    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  41.48 
 
 
831 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  100 
 
 
784 aa  1641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  40.62 
 
 
819 aa  626  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  41.03 
 
 
811 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  40.41 
 
 
822 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  40.23 
 
 
815 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  38.73 
 
 
822 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  38.26 
 
 
827 aa  572  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  37.53 
 
 
797 aa  561  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  36.12 
 
 
829 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  38.24 
 
 
801 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  37.98 
 
 
797 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  36.05 
 
 
802 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  35.93 
 
 
802 aa  535  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  35.84 
 
 
794 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  36.55 
 
 
796 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  35.83 
 
 
823 aa  525  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  36.43 
 
 
809 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  35.51 
 
 
824 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  36.11 
 
 
762 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  35.64 
 
 
797 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  32.25 
 
 
849 aa  428  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  30.37 
 
 
786 aa  420  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  29.06 
 
 
2887 aa  356  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  30.69 
 
 
2888 aa  349  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  29.14 
 
 
2922 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  29.87 
 
 
2823 aa  346  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  29.15 
 
 
3021 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  27.32 
 
 
1303 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  29.67 
 
 
2732 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  30.08 
 
 
2864 aa  337  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.08 
 
 
2859 aa  336  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  27.09 
 
 
2929 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  28.43 
 
 
2748 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.74 
 
 
2901 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  28.25 
 
 
2864 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  29.87 
 
 
2839 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  27.76 
 
 
2831 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  29.28 
 
 
2842 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  27.99 
 
 
2864 aa  313  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  27.76 
 
 
2868 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  27.31 
 
 
2860 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  27.2 
 
 
2786 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  26.54 
 
 
2916 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  27.61 
 
 
2875 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  29.1 
 
 
2839 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  28.29 
 
 
2716 aa  303  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  26.94 
 
 
2880 aa  303  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  27.2 
 
 
2932 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  27.8 
 
 
2874 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  28.16 
 
 
2845 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  27.48 
 
 
2747 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  27.78 
 
 
2884 aa  295  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.48 
 
 
2748 aa  294  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  27.34 
 
 
2761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.18 
 
 
2868 aa  287  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  27.08 
 
 
2758 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  30.4 
 
 
624 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  28.1 
 
 
2870 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  26.64 
 
 
2905 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  27.2 
 
 
2881 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  27.65 
 
 
2833 aa  279  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  27.56 
 
 
2769 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.61 
 
 
788 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  25.95 
 
 
2730 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  25.1 
 
 
2731 aa  224  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.01 
 
 
2793 aa  224  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  23.87 
 
 
2779 aa  221  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  23.74 
 
 
802 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  24.38 
 
 
801 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  22.49 
 
 
984 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  28.21 
 
 
2453 aa  96.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  20.65 
 
 
900 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  26.92 
 
 
1145 aa  54.7  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  19.61 
 
 
904 aa  52.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  24.22 
 
 
1100 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  24.26 
 
 
1076 aa  47.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  22.88 
 
 
1136 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  20.99 
 
 
1113 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>