272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1425 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 137 aa  265  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  58.78 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  57.25 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  54.96 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  51.52 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  54.48 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  54.96 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  54.96 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  54.96 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  56.39 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  54.62 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  54.62 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  53.44 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  54.62 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  51.54 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  52.27 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  52.27 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  53.08 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  54.96 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  54.62 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  53.08 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  52.31 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  51.91 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  52.27 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  51.13 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  56.06 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  51.85 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  58.14 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  48.12 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  47.33 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  48.85 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  57.46 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  53.44 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  49.23 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  53.44 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  50.37 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  52.9 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  49.64 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  55.05 
 
 		 110 aa  121  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  48.92 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  45.86 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  48.46 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  45.39 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  47.22 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  47.41 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  47.45 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  47.45 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  41.96 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  48.91 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  45.83 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  48.85 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  46.53 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  45.11 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  43.88 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  46.43 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  45.59 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  47.18 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 		 159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1655  large conductance mechanosensitive channel protein  49.19 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  51.54 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  46.27 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  44.93 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  47.18 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  43.88 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  45.99 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  46.92 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  45.26 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  45.39 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>