244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1415 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  100 
 
 		 231 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  50.43 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  52.21 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  53.15 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  48.91 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  47.64 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  42.79 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  39.73 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  42.34 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  39.73 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  39.19 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  38.29 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  38.74 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  38.29 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  37.89 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  39.46 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  36.14 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  36.14 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  35.91 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  34.22 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  37.78 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  37.78 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  37.37 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  35.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  37.37 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  36.36 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  37 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  36.16 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  36.32 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  36.55 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  37.56 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  36.18 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  37.07 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  37.56 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  37.37 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  37.56 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  37.56 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  36.32 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  37.56 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  36.18 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  34.53 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  36.62 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  35.68 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  35.68 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  35.68 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  35.68 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  35.68 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  35.68 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  35.68 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  35.27 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  36.04 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  37.79 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  36.07 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  32.42 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  36.07 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  35.07 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  32.42 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  31.65 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  33.94 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  35.38 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  35.16 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  31.67 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  30.91 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  33.33 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  36.92 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  33.33 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  31.36 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  31.82 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  31.82 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  36.4 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  36.18 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  33.97 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  33.33 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  35.51 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  35.51 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  35.51 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  35.51 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  32.11 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  35.51 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  32.44 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  34.88 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  34.95 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  34.26 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  32.43 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  38.03 
 
 		 241 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  34.42 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  35.96 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>