More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1399 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0306  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  71.11 
 
 		 727 aa  1059    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000446008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1399  DNA gyrase/topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 728 aa  1482    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000271013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  34.83 
 
 		 818 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  34.6 
 
 		 825 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  34.97 
 
 		 823 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  33.82 
 
 		 809 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  34.68 
 
 		 823 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  35.26 
 
 		 823 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  34.68 
 
 		 823 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  34.68 
 
 		 823 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  34.83 
 
 		 823 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  34.63 
 
 		 840 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  34.68 
 
 		 823 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  34.34 
 
 		 870 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  35.04 
 
 		 865 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  34.68 
 
 		 823 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  34.68 
 
 		 823 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  34.41 
 
 		 932 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  33.67 
 
 		 806 aa  392  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  34.97 
 
 		 809 aa  392  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  33.94 
 
 		 811 aa  391  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  34.83 
 
 		 821 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  34.68 
 
 		 823 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  32.83 
 
 		 853 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  32.81 
 
 		 796 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  33.05 
 
 		 893 aa  385  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  35.89 
 
 		 807 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0441  DNA gyrase, A subunit  33.47 
 
 		 810 aa  383  1e-105  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.624683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  32.25 
 
 		 812 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  33.14 
 
 		 835 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  35.36 
 
 		 824 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  33.43 
 
 		 832 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  35.01 
 
 		 809 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  33.47 
 
 		 836 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  33.2 
 
 		 836 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  31.89 
 
 		 857 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  31.89 
 
 		 857 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  33 
 
 		 827 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  33.86 
 
 		 889 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  33.86 
 
 		 889 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  33.51 
 
 		 839 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  33.51 
 
 		 839 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  34.42 
 
 		 883 aa  382  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  34.31 
 
 		 805 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  34.27 
 
 		 807 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  31.39 
 
 		 913 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  32.8 
 
 		 823 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  32.05 
 
 		 802 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0006  DNA gyrase subunit A  32.62 
 
 		 871 aa  379  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.307841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  35.34 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  35.11 
 
 		 827 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  32.19 
 
 		 875 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  31.08 
 
 		 853 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1238  DNA gyrase, A subunit  33 
 
 		 813 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  33.14 
 
 		 823 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  32.8 
 
 		 898 aa  373  1e-102  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  31.5 
 
 		 875 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  34.11 
 
 		 814 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  34.38 
 
 		 820 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  32.37 
 
 		 852 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  32.08 
 
 		 813 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  34.45 
 
 		 857 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  32.24 
 
 		 834 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  33.09 
 
 		 949 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  30.81 
 
 		 811 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  30.25 
 
 		 855 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  35.14 
 
 		 834 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  33.82 
 
 		 812 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  32.02 
 
 		 809 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  30.48 
 
 		 864 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  33.75 
 
 		 883 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1633  DNA gyrase, A subunit  34.8 
 
 		 829 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0894525  normal  0.0126179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4317  DNA gyrase, A subunit  31.71 
 
 		 914 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  31.29 
 
 		 912 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  31.36 
 
 		 809 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  34.39 
 
 		 819 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  32.42 
 
 		 841 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  33.18 
 
 		 872 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  31.24 
 
 		 828 aa  365  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  31.51 
 
 		 849 aa  364  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  34.13 
 
 		 857 aa  364  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  32.15 
 
 		 839 aa  364  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3041  DNA gyrase subunit A  31.13 
 
 		 883 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.894078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  34.55 
 
 		 819 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  30.85 
 
 		 928 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  33.53 
 
 		 815 aa  363  6e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  32.27 
 
 		 806 aa  363  6e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  30.97 
 
 		 913 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  34.19 
 
 		 818 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  30.23 
 
 		 860 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  33.88 
 
 		 848 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  34.6 
 
 		 788 aa  362  1e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  32.2 
 
 		 828 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  34.35 
 
 		 811 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  34.17 
 
 		 883 aa  361  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  33.85 
 
 		 838 aa  362  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  30.94 
 
 		 869 aa  361  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  33.42 
 
 		 848 aa  361  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  31.85 
 
 		 834 aa  361  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  30.01 
 
 		 856 aa  360  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>