More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1392 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 413 aa  841    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  65.93 
 
 		 414 aa  567  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  65.69 
 
 		 414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  66.18 
 
 		 415 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  65.53 
 
 		 414 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  64.63 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  64.63 
 
 		 412 aa  552  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  63.73 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  62.47 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  60.1 
 
 		 413 aa  521  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  60.64 
 
 		 427 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  58.72 
 
 		 428 aa  504  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  56.45 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  50.36 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  49.28 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  51.57 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  47.37 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  46.41 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  47.96 
 
 		 694 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  46.39 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  47.94 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  45.26 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  46.1 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  43.75 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  44.79 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  43.27 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  43.69 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  43.27 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  43.69 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  45.17 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  44.82 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  44.6 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 434 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  46.02 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  44.58 
 
 		 433 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  42.38 
 
 		 433 aa  362  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  42.93 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  44.2 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  43.1 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  43.58 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  42.86 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  42.55 
 
 		 433 aa  359  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  44.69 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  43.45 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  42.31 
 
 		 432 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 438 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  44.36 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  43.58 
 
 		 435 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  43.27 
 
 		 433 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  43.51 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  41.93 
 
 		 435 aa  352  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  43.61 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  43.45 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  43.24 
 
 		 446 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  44.55 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  43.91 
 
 		 431 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  43.1 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  41.75 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  41.35 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  43.45 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  42.62 
 
 		 434 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  41.12 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  41.83 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  41.16 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  41.83 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  41.97 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  41.73 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  43.1 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  43.24 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  42.31 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  41.19 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  42.55 
 
 		 445 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  42.37 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  42.11 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  43.69 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  41.59 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  42.82 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  41.79 
 
 		 444 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  43.8 
 
 		 434 aa  342  9e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  43.2 
 
 		 432 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  42.08 
 
 		 433 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  43.45 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  41.49 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  43.69 
 
 		 432 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  41.63 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  41.93 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  42.96 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  39.56 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  43.2 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  42.55 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  42.72 
 
 		 445 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  40.87 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  41.3 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  41.49 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  40.43 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>