More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1384 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  100 
 
 
518 aa  1070  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  7.21481e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  61.49 
 
 
513 aa  678  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  67.37 
 
 
518 aa  741  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  61.9 
 
 
517 aa  694  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  76.64 
 
 
518 aa  835  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  67.76 
 
 
518 aa  744  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  63.14 
 
 
512 aa  679  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  73.55 
 
 
518 aa  806  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.07492e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  75.1 
 
 
518 aa  813  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  56.01 
 
 
517 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  57.53 
 
 
517 aa  617  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  56.23 
 
 
530 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  55.84 
 
 
517 aa  612  1e-174  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  55.25 
 
 
517 aa  613  1e-174  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  55.06 
 
 
517 aa  614  1e-174  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
517 aa  612  1e-174  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  56.03 
 
 
517 aa  614  1e-174  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 
517 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  55.84 
 
 
517 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  55.84 
 
 
517 aa  608  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 
517 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
514 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  51.66 
 
 
510 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 
514 aa  518  1e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
514 aa  516  1e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
514 aa  517  1e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
514 aa  506  1e-142  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
514 aa  492  1e-138  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  51.46 
 
 
514 aa  492  1e-138  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  51.46 
 
 
514 aa  492  1e-138  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
515 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  42.39 
 
 
515 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  41.59 
 
 
523 aa  415  1e-115  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  45.14 
 
 
515 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  5.24631e-06 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
512 aa  408  1e-112  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  42.38 
 
 
512 aa  408  1e-112  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  38.88 
 
 
513 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  40.5 
 
 
523 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  40.2 
 
 
518 aa  389  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  40.08 
 
 
510 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  39.31 
 
 
519 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.33 
 
 
645 aa  361  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  36.9 
 
 
636 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  36.82 
 
 
635 aa  339  7e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.78 
 
 
644 aa  335  8e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 
636 aa  333  4e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
641 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  35.7 
 
 
639 aa  329  8e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 
659 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  36.63 
 
 
642 aa  327  4e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  36.63 
 
 
642 aa  327  4e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90627e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.68 
 
 
643 aa  327  5e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  37.04 
 
 
638 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.23212e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.31 
 
 
634 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  35.46 
 
 
634 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
644 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  37.62 
 
 
630 aa  320  4e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  36.71 
 
 
564 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
662 aa  320  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 
640 aa  320  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 
644 aa  319  9e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
658 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
658 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  37.08 
 
 
575 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
658 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
659 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 
658 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.55 
 
 
658 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
644 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  36.85 
 
 
581 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  34.11 
 
 
639 aa  313  3e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.1 
 
 
545 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  34.3 
 
 
535 aa  311  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  37.28 
 
 
567 aa  307  2e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 
632 aa  304  2e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.91 
 
 
646 aa  304  3e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  1.54774e-07  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  35.38 
 
 
666 aa  303  4e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  34.62 
 
 
549 aa  303  4e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.66 
 
 
668 aa  302  8e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  1.02079e-06  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.48 
 
 
544 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.6 
 
 
690 aa  299  8e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.72 
 
 
560 aa  299  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  36.35 
 
 
643 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.95 
 
 
564 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
643 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.78 
 
 
548 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.46 
 
 
545 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.27 
 
 
540 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  33.66 
 
 
649 aa  292  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.27 
 
 
540 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  34.26 
 
 
540 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.27 
 
 
540 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
548 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  34.04 
 
 
542 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.32577e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.39 
 
 
548 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
656 aa  290  5e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  34.26 
 
 
540 aa  290  5e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.15 
 
 
649 aa  289  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.27 
 
 
543 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.14 
 
 
543 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>