More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1376 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  100 
 
 
594 aa  1207  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.47431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
1016 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.52 
 
 
1009 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  33.33 
 
 
506 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  33.51 
 
 
1821 aa  97.8  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  33.71 
 
 
506 aa  97.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  33.15 
 
 
733 aa  94  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  29.76 
 
 
693 aa  93.2  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  33.14 
 
 
935 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  30.11 
 
 
1174 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  28.3 
 
 
1226 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  30.99 
 
 
758 aa  90.5  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  33.18 
 
 
526 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  25.85 
 
 
880 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35.03 
 
 
1042 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  29.8 
 
 
375 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  30.11 
 
 
548 aa  88.6  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  33.5 
 
 
820 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  28.8 
 
 
1013 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.86 
 
 
631 aa  87.4  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  30.43 
 
 
932 aa  85.9  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  35.26 
 
 
548 aa  85.1  4e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.84 
 
 
1847 aa  84.3  6e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  31.4 
 
 
625 aa  82.4  2e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  28.9 
 
 
756 aa  82.8  2e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.24 
 
 
1029 aa  82.8  2e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  28.33 
 
 
524 aa  82  3e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.4 
 
 
2286 aa  81.6  3e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  30.98 
 
 
914 aa  81.6  4e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.25 
 
 
1661 aa  81.3  5e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  29.41 
 
 
754 aa  80.5  7e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  31.18 
 
 
518 aa  80.5  8e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  32.35 
 
 
457 aa  80.5  8e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  33.58 
 
 
578 aa  80.5  9e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.25317e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  28.44 
 
 
939 aa  80.5  9e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  28.99 
 
 
218 aa  79.7  1e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  29.28 
 
 
1457 aa  80.1  1e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  30.34 
 
 
573 aa  79.3  2e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  29.21 
 
 
920 aa  78.6  3e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  27.17 
 
 
2207 aa  78.6  3e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  30.32 
 
 
223 aa  78.2  4e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.1 
 
 
2073 aa  77.8  5e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1129  S-layer protein  36.45 
 
 
219 aa  77.4  6e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.401991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1049  S-layer protein  36.45 
 
 
219 aa  77.4  6e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  31.31 
 
 
935 aa  77.8  6e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  29.94 
 
 
1168 aa  77.8  6e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  29.83 
 
 
554 aa  77.4  7e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  27.69 
 
 
1729 aa  77.4  8e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  6.07429e-05 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1207  putative S-layer protein  35.51 
 
 
219 aa  77  9e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.341169 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  29.02 
 
 
484 aa  76.6  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  28.45 
 
 
288 aa  76.6  1e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  27.64 
 
 
413 aa  76.6  1e-12  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  27.68 
 
 
4630 aa  76.6  1e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.3 
 
 
6885 aa  75.9  2e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.4 
 
 
459 aa  75.9  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.45238e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4531  S-layer region-like  26.13 
 
 
231 aa  75.9  2e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  27.57 
 
 
413 aa  75.9  2e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  29.41 
 
 
404 aa  75.9  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3791e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.4 
 
 
459 aa  75.9  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  35.4 
 
 
459 aa  75.9  2e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  26.06 
 
 
2178 aa  75.5  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  29.02 
 
 
489 aa  75.5  3e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  30.23 
 
 
618 aa  75.1  3e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  35.51 
 
 
218 aa  75.5  3e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  25.28 
 
 
414 aa  74.7  4e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1284  putative S-layer protein  35.51 
 
 
219 aa  75.1  4e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0896591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  33.59 
 
 
223 aa  74.7  5e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  9.83689e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  33.59 
 
 
223 aa  74.7  5e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  33.59 
 
 
223 aa  74.7  5e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1226  S-layer protein, putative  35.51 
 
 
275 aa  74.3  6e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  39.13 
 
 
218 aa  74.3  6e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  39.13 
 
 
218 aa  74.3  6e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  30.63 
 
 
376 aa  74.3  6e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  39.13 
 
 
218 aa  74.3  6e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  28.9 
 
 
1194 aa  73.9  7e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2693  S-layer domain protein  33.33 
 
 
189 aa  73.9  7e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  30.63 
 
 
376 aa  73.9  7e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  33.58 
 
 
578 aa  73.9  7e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.85936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  30.59 
 
 
379 aa  73.9  8e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.49153e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  33.58 
 
 
577 aa  73.9  9e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  33.58 
 
 
577 aa  73.9  9e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  33.58 
 
 
578 aa  73.2  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.97101e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  28.81 
 
 
1208 aa  73.6  1e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1027  S-layer protein  34.58 
 
 
219 aa  72.8  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  36.19 
 
 
220 aa  73.2  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.89 
 
 
995 aa  73.6  1e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  32.84 
 
 
578 aa  73.2  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  26.41 
 
 
575 aa  73.2  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28 
 
 
1495 aa  72.4  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1025  S-layer protein  36.45 
 
 
285 aa  72.4  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  27.67 
 
 
631 aa  72  3e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4160  S-layer domain protein  31.19 
 
 
218 aa  71.2  4e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.75 
 
 
1054 aa  71.2  5e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.08 
 
 
529 aa  71.2  5e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.10888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  24.89 
 
 
807 aa  71.2  5e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1179  S-layer domain protein  31.19 
 
 
218 aa  71.2  6e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1282  putative S-layer protein  36.19 
 
 
223 aa  70.9  6e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.08 
 
 
529 aa  70.9  6e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.28713e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1225  S-layer protein, putative  36.19 
 
 
223 aa  70.9  7e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  35.19 
 
 
219 aa  70.9  7e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>