More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1373 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0748  threonyl-tRNA synthetase  66.25 
 
 
652 aa  903  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  641  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 
635 aa  783  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 
635 aa  767  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.83369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
645 aa  1333  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.40223e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  69.83 
 
 
646 aa  959  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.88041e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  64.22 
 
 
647 aa  891  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
644 aa  662  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.86283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  641  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  640  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.66692e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
645 aa  641  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.71694e-05  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
643 aa  642  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.753e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 
634 aa  679  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
635 aa  651  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
633 aa  652  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  641  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
645 aa  641  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
635 aa  687  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 
643 aa  971  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  641  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
635 aa  637  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  641  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
648 aa  661  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
634 aa  660  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
652 aa  657  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  641  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
645 aa  641  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 
643 aa  970  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
638 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
662 aa  619  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
645 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
645 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
645 aa  607  1e-172  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
639 aa  607  1e-172  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
645 aa  604  1e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
636 aa  605  1e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
648 aa  603  1e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
636 aa  602  1e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
647 aa  603  1e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
643 aa  604  1e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
638 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
637 aa  601  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
636 aa  598  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
648 aa  598  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
646 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
659 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
636 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
641 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 
645 aa  591  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
640 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
636 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  585  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
640 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
646 aa  585  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
641 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
636 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.92835e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
635 aa  583  1e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
640 aa  583  1e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
635 aa  584  1e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
639 aa  582  1e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
596 aa  582  1e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
639 aa  578  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
638 aa  578  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
635 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
640 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
644 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  9.9925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
639 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
640 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
638 aa  577  1e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
677 aa  575  1e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
640 aa  578  1e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
635 aa  572  1e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
647 aa  572  1e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
657 aa  575  1e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
635 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
647 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
640 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
644 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
635 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
657 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
635 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
657 aa  565  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
635 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
645 aa  568  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
635 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
635 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
636 aa  564  1e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
584 aa  563  1e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
635 aa  564  1e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
638 aa  563  1e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>