More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1372 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  70 
 
 
634 aa  926    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 
635 aa  864    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
640 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 
636 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
640 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
640 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  77.88 
 
 
635 aa  1050    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
638 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 
635 aa  929    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
635 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
640 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
644 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 
640 aa  663    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  53 
 
 
640 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
640 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
639 aa  723    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
640 aa  692    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
639 aa  721    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
637 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  53 
 
 
639 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
635 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
637 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
637 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
640 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
644 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.49 
 
 
638 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
640 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
635 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
635 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
637 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
644 aa  659    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
640 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
644 aa  677    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
640 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
638 aa  641    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
638 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 
635 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 
644 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
639 aa  663    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
641 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
645 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
644 aa  705    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
642 aa  663    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
639 aa  723    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
635 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
640 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
638 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
639 aa  721    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  63.13 
 
 
633 aa  862    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
635 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
640 aa  708    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
640 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
635 aa  692    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
640 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
639 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
669 aa  677    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
636 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  59.82 
 
 
586 aa  717    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
635 aa  676    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
635 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
635 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
635 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
644 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
640 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
644 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
635 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
643 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
645 aa  721    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 
584 aa  751    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
635 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
637 aa  695    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 
636 aa  797    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 
636 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
640 aa  715    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
638 aa  658    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 
646 aa  698    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 
638 aa  701    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
644 aa  671    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
641 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
640 aa  692    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 
635 aa  886    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
635 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
635 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
640 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
636 aa  691    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
639 aa  709    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
635 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
644 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
648 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
635 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
636 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
639 aa  711    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>