16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1335 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1335  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.47457e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1268  hypothetical protein  62.03 
 
 
81 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.277803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1090  hypothetical protein  60.76 
 
 
81 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.869282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3728  hypothetical protein  58.23 
 
 
82 aa  91.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0742  hypothetical protein  50.63 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.568027  normal  0.756867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3227  hypothetical protein  52 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.61134e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01280  hypothetical protein  50.63 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0611  hypothetical protein  56.52 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0909  hypothetical protein  53.85 
 
 
81 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.593051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3016  hypothetical protein  53.42 
 
 
84 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.93406e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1110  hypothetical protein  47.95 
 
 
102 aa  82  2e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.578339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1398  hypothetical protein  50.67 
 
 
85 aa  81.3  4e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2812  hypothetical protein  49.33 
 
 
108 aa  81.6  4e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1149  hypothetical protein  46.34 
 
 
106 aa  77.8  5e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2789  hypothetical protein  39.19 
 
 
82 aa  68.9  2e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1637  hypothetical protein  41.33 
 
 
83 aa  68.2  4e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>