More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1320 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  205  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  74.76 
 
 		 103 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  64.36 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 103 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 103 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 102 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 102 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  55 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  55 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.66 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 100 aa  100  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 224 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 100 aa  96.7  9e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>