227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1298 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  100 
 
 
477 aa  994  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.71564e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  50.62 
 
 
1748 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  45.67 
 
 
412 aa  349  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
445 aa  328  1e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 
381 aa  306  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  37.26 
 
 
432 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  37.44 
 
 
430 aa  290  5e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  37.82 
 
 
376 aa  267  3e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 
912 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 
292 aa  249  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  35.75 
 
 
377 aa  219  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  31.81 
 
 
460 aa  180  6e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 
477 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  44.86 
 
 
106 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  25.73 
 
 
1223 aa  94.7  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  60.66 
 
 
435 aa  82.8  1e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.88378e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  27.73 
 
 
366 aa  77  7e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  56.52 
 
 
955 aa  75.5  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  48.48 
 
 
780 aa  73.9  6e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  46.81 
 
 
873 aa  72.8  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  47.14 
 
 
423 aa  73.2  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  52.17 
 
 
715 aa  72  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  23.55 
 
 
465 aa  71.6  3e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  25.73 
 
 
337 aa  70.5  6e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  28.45 
 
 
332 aa  70.5  7e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  52.24 
 
 
298 aa  70.1  9e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.69346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  52.31 
 
 
630 aa  68.6  2e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  44.74 
 
 
532 aa  69.3  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  27.78 
 
 
376 aa  68.6  2e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  48.05 
 
 
462 aa  68.6  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  44.78 
 
 
425 aa  68.9  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  49.25 
 
 
725 aa  68.6  3e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  53.23 
 
 
308 aa  67.8  4e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  56.9 
 
 
536 aa  67.8  4e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  43.33 
 
 
554 aa  67.4  5e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  44.12 
 
 
295 aa  67.4  6e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  45.59 
 
 
303 aa  67.4  6e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  24.22 
 
 
1152 aa  67  6e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  50 
 
 
621 aa  67  7e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  37.5 
 
 
539 aa  67  7e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
1140 aa  66.6  9e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  46.88 
 
 
524 aa  66.2  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  41.25 
 
 
848 aa  66.2  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
746 aa  65.5  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  50.75 
 
 
646 aa  65.9  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  46.84 
 
 
584 aa  65.1  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 
408 aa  65.9  2e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  58.18 
 
 
482 aa  65.5  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  51.72 
 
 
541 aa  64.7  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  50.82 
 
 
311 aa  65.1  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  45.59 
 
 
885 aa  65.1  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 
951 aa  65.1  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  37.89 
 
 
526 aa  64.7  4e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.24089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  26.83 
 
 
543 aa  64.7  4e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  7.86066e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  46.48 
 
 
415 aa  64.7  4e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  49.23 
 
 
737 aa  64.3  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  44 
 
 
509 aa  63.9  6e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  49.18 
 
 
490 aa  63.5  7e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  41.25 
 
 
949 aa  63.5  8e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.76 
 
 
375 aa  63.2  9e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
376 aa  63.5  9e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  46.77 
 
 
722 aa  62.8  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  24.13 
 
 
1140 aa  62.8  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  47.76 
 
 
961 aa  62.8  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 
511 aa  62.8  1e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 
649 aa  62.8  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  25.66 
 
 
330 aa  62.4  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 
580 aa  62.4  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 
1140 aa  62.8  2e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  45.31 
 
 
730 aa  61.6  3e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  24.11 
 
 
429 aa  61.6  3e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  26.51 
 
 
390 aa  61.2  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  50.79 
 
 
965 aa  61.2  3e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  47.46 
 
 
604 aa  60.8  5e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  24.11 
 
 
419 aa  60.8  5e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 
563 aa  60.5  6e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.15938e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  45.76 
 
 
535 aa  60.5  7e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  36.08 
 
 
436 aa  60.5  7e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  23.35 
 
 
332 aa  59.3  1e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  37.66 
 
 
567 aa  59.3  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 
566 aa  59.3  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.42 
 
 
537 aa  59.3  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  41.43 
 
 
552 aa  59.3  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 
591 aa  59.3  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  42.65 
 
 
391 aa  59.3  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  45.71 
 
 
583 aa  58.5  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.98696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  44.62 
 
 
1015 aa  58.5  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.98242e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  46.77 
 
 
316 aa  58.5  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  37.33 
 
 
471 aa  58.5  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  44.83 
 
 
1122 aa  58.2  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  51.67 
 
 
874 aa  58.5  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.3 
 
 
411 aa  58.2  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  43.08 
 
 
773 aa  58.5  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 
742 aa  58.5  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  25.52 
 
 
421 aa  57.8  4e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.68 
 
 
831 aa  57.8  4e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  45.31 
 
 
789 aa  57.8  4e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  48.44 
 
 
833 aa  57.8  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  46.67 
 
 
686 aa  58.2  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.27885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  43.48 
 
 
922 aa  57.4  5e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>