More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1276 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  100 
 
 		 407 aa  836    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  49 
 
 		 655 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  40.08 
 
 		 269 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  41.59 
 
 		 249 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  35.95 
 
 		 254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  33.59 
 
 		 258 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  34.15 
 
 		 259 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.48 
 
 		 512 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  36.63 
 
 		 256 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  34.48 
 
 		 263 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  34.06 
 
 		 253 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  34.63 
 
 		 263 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  34.05 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  34.05 
 
 		 263 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  33.62 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  33.05 
 
 		 255 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  31.51 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  34.35 
 
 		 264 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  31.95 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  38.19 
 
 		 151 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  32.31 
 
 		 250 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  29.61 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  45.11 
 
 		 142 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  29.72 
 
 		 261 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  30.74 
 
 		 254 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  30.74 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  29.41 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  29 
 
 		 258 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  28.57 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  37.24 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  29.91 
 
 		 254 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  37.24 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  33.49 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  33.79 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  29.27 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  36.81 
 
 		 155 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  29.37 
 
 		 266 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  30.74 
 
 		 519 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  29.02 
 
 		 248 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.07 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  32.17 
 
 		 213 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  34.03 
 
 		 224 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  30.26 
 
 		 246 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.24 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  29.63 
 
 		 244 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  34.03 
 
 		 462 aa  90.1  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  32.39 
 
 		 313 aa  90.1  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.64 
 
 		 554 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  31.94 
 
 		 182 aa  89.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.56 
 
 		 476 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  35.92 
 
 		 212 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.47 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  30.5 
 
 		 209 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  32.17 
 
 		 280 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.87 
 
 		 493 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  29.22 
 
 		 257 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  36.99 
 
 		 149 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  27.9 
 
 		 247 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  27.47 
 
 		 247 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  29.46 
 
 		 244 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  31.51 
 
 		 218 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  30.14 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  29.29 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  35.66 
 
 		 153 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  28.14 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  33.53 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  28.47 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.47 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  28.47 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  27.04 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.17 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  27.66 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  29.11 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  26.64 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  32.11 
 
 		 254 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.04 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  30.5 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  29.41 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  36.61 
 
 		 197 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  29.8 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  28.86 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  31.86 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  28.86 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  26.78 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  26 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.87 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  29.37 
 
 		 235 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  29.88 
 
 		 246 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.72 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  27.97 
 
 		 251 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  32.64 
 
 		 224 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  25.82 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  27.35 
 
 		 273 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  32.64 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  33.1 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.59 
 
 		 824 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  27.05 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  32.62 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  32.62 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>