41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1258 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  100 
 
 		 376 aa  784    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  54.62 
 
 		 381 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  37.82 
 
 		 477 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  36.46 
 
 		 1748 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  42.37 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  37.82 
 
 		 430 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  35.94 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  35.47 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  36.52 
 
 		 912 aa  215  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  39.46 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  21.6 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 		 477 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  37.38 
 
 		 106 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  23.36 
 
 		 1223 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  25.81 
 
 		 2690 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  23.58 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 1140 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  29.41 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  32.99 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  24.87 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  27.73 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  31.97 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  22.59 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  22.82 
 
 		 453 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  21.29 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 1140 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 1140 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  22.29 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  22.59 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  23.18 
 
 		 1152 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  22.59 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  22.59 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  20.75 
 
 		 609 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 1129 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  24.64 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  23.5 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  22.69 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  21.15 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  27.96 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>