111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1245 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  100 
 
 		 552 aa  1128    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  42.49 
 
 		 350 aa  282  9e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  60.81 
 
 		 560 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  57.87 
 
 		 848 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  38.7 
 
 		 666 aa  246  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  40 
 
 		 396 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  43.46 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  52.75 
 
 		 567 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  35.46 
 
 		 416 aa  210  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  38.36 
 
 		 700 aa  190  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  31.56 
 
 		 460 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  30.95 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  24.9 
 
 		 547 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  38.03 
 
 		 839 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  43.9 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  60 
 
 		 874 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  54.84 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  54.39 
 
 		 722 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 		 686 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  49.18 
 
 		 737 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  32.26 
 
 		 1171 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  39.13 
 
 		 873 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  51.52 
 
 		 949 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1353  secreted pectate lyase-family protein  20.71 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  40.48 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  38.78 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  41.43 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  47.54 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  46.3 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  50.91 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  50.91 
 
 		 885 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  47.69 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  48.39 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.33 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  49.15 
 
 		 833 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  40.68 
 
 		 742 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 773 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  42.47 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  35.16 
 
 		 584 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 477 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  39.24 
 
 		 639 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  30.89 
 
 		 524 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  33.33 
 
 		 316 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 619 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  52.73 
 
 		 780 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  43.1 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  41.89 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  34.19 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  45 
 
 		 646 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  43.64 
 
 		 746 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.7 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 308 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  37.68 
 
 		 423 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  46.43 
 
 		 621 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  42.62 
 
 		 471 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  41.82 
 
 		 539 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 		 707 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 490 aa  50.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  43.64 
 
 		 295 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  45.45 
 
 		 303 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  40.98 
 
 		 814 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  40.58 
 
 		 961 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  39.24 
 
 		 955 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  39.34 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  40.98 
 
 		 611 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  42.37 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  38.6 
 
 		 710 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  32.04 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  37 
 
 		 583 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  30.77 
 
 		 600 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  35.37 
 
 		 554 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  41.82 
 
 		 462 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  27.15 
 
 		 928 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  38.98 
 
 		 298 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 1601 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.44 
 
 		 411 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 789 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.92 
 
 		 1209 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  38.6 
 
 		 590 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.07 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.18 
 
 		 1051 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  42.37 
 
 		 895 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 		 730 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  45.9 
 
 		 679 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  36.07 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  36.76 
 
 		 900 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 741 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 965 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  37.29 
 
 		 591 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  36.49 
 
 		 683 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  43.64 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 		 436 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.1 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.07 
 
 		 982 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  33.62 
 
 		 778 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  29.1 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  41.82 
 
 		 604 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>