More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1241 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1164 aa  2396    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  41.68 
 
 		 842 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.36 
 
 		 1094 aa  569  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  41.16 
 
 		 816 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  40.78 
 
 		 811 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  41.06 
 
 		 768 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  39.23 
 
 		 825 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  39.25 
 
 		 741 aa  532  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  43.37 
 
 		 940 aa  529  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  38.39 
 
 		 747 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  39.13 
 
 		 822 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 784 aa  511  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  39.07 
 
 		 868 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  37.23 
 
 		 864 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  38.67 
 
 		 825 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  36.81 
 
 		 833 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  37.77 
 
 		 841 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  38.92 
 
 		 1193 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  37.38 
 
 		 1479 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  36.34 
 
 		 802 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  39.78 
 
 		 759 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1139 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  36.08 
 
 		 786 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  37.53 
 
 		 781 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  38.01 
 
 		 803 aa  445  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  36.51 
 
 		 991 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  35.65 
 
 		 790 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  35.92 
 
 		 742 aa  426  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  34.22 
 
 		 757 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  34.7 
 
 		 758 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  34.26 
 
 		 778 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 835 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  33.38 
 
 		 824 aa  363  7.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  31.26 
 
 		 809 aa  362  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  32.14 
 
 		 760 aa  354  5.9999999999999994e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  33.91 
 
 		 831 aa  353  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  31.31 
 
 		 856 aa  350  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 		 781 aa  329  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  30.34 
 
 		 796 aa  320  7.999999999999999e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  28.41 
 
 		 837 aa  307  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  71 
 
 		 604 aa  297  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  67.15 
 
 		 1122 aa  294  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.45 
 
 		 943 aa  292  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  33.4 
 
 		 646 aa  291  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  29.91 
 
 		 788 aa  289  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  67.15 
 
 		 536 aa  288  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  75.5 
 
 		 629 aa  286  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  66.34 
 
 		 746 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.55 
 
 		 762 aa  283  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  65.38 
 
 		 541 aa  281  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  66.67 
 
 		 1015 aa  277  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  29.4 
 
 		 804 aa  275  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  65.57 
 
 		 780 aa  274  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  28.57 
 
 		 809 aa  264  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  27.57 
 
 		 773 aa  261  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  50.6 
 
 		 965 aa  242  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  60.8 
 
 		 490 aa  241  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  56.62 
 
 		 951 aa  240  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  26.35 
 
 		 819 aa  238  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  50.86 
 
 		 928 aa  235  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  54.85 
 
 		 501 aa  233  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  30.72 
 
 		 808 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  54.27 
 
 		 524 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  58.16 
 
 		 535 aa  207  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  51.16 
 
 		 509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  50.49 
 
 		 533 aa  174  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  23.35 
 
 		 809 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  43.07 
 
 		 679 aa  155  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 		 683 aa  153  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  56.43 
 
 		 454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  52.94 
 
 		 912 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.51 
 
 		 837 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  37.5 
 
 		 630 aa  142  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  50.37 
 
 		 618 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  44.12 
 
 		 464 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  23.72 
 
 		 757 aa  121  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  46.21 
 
 		 1290 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  43.18 
 
 		 479 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  35.26 
 
 		 262 aa  112  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  44.03 
 
 		 469 aa  108  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 470 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  42.42 
 
 		 479 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  44.78 
 
 		 566 aa  103  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  23.51 
 
 		 753 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.41 
 
 		 344 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 		 880 aa  100  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  19.95 
 
 		 770 aa  99.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  54.12 
 
 		 116 aa  98.6  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  43.17 
 
 		 899 aa  96.3  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.08 
 
 		 350 aa  94.7  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.15 
 
 		 801 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 807 aa  91.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 807 aa  89.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  37.34 
 
 		 1186 aa  88.2  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  32.51 
 
 		 1127 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.88 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  38.06 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  37.12 
 
 		 630 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  42.28 
 
 		 834 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.06 
 
 		 945 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>