More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1239 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  49.81 
 
 
805 aa  766  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 
1015 aa  2080  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.98242e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  45.58 
 
 
806 aa  679  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  41.5 
 
 
1355 aa  651  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  73.54 
 
 
928 aa  1414  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 
827 aa  684  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.09 
 
 
813 aa  614  1e-174  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  40.66 
 
 
873 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  40.53 
 
 
919 aa  598  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.76 
 
 
1781 aa  594  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.36 
 
 
903 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  38.23 
 
 
922 aa  565  1e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.62 
 
 
794 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.31 
 
 
986 aa  543  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  37.39 
 
 
1185 aa  545  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.42 
 
 
824 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  38.4 
 
 
832 aa  539  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.24 
 
 
787 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  37.75 
 
 
891 aa  524  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.5 
 
 
805 aa  499  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  35.72 
 
 
984 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  35.24 
 
 
925 aa  466  1e-130  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.07 
 
 
811 aa  469  1e-130  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  35.01 
 
 
932 aa  456  1e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  33.78 
 
 
815 aa  455  1e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  32.69 
 
 
859 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  2.11988e-05 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  34.31 
 
 
964 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
807 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  34.61 
 
 
961 aa  441  1e-122  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.62 
 
 
1093 aa  434  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 
806 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  39.55 
 
 
604 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 
825 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.77 
 
 
837 aa  386  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
799 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 
829 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 
858 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.08 
 
 
808 aa  362  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  71.56 
 
 
604 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  71.98 
 
 
1122 aa  311  3e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 
655 aa  299  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.53 
 
 
882 aa  296  9e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  28.94 
 
 
862 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  31.4 
 
 
704 aa  286  1e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  65.09 
 
 
541 aa  282  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  65.57 
 
 
746 aa  282  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  64.93 
 
 
536 aa  278  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  30.54 
 
 
707 aa  275  2e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.39 
 
 
750 aa  274  8e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.0433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  60.93 
 
 
780 aa  270  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.9 
 
 
743 aa  257  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  66.67 
 
 
1164 aa  256  1e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  28.47 
 
 
897 aa  254  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 
888 aa  251  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  50.19 
 
 
965 aa  244  4e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  66.33 
 
 
629 aa  244  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
979 aa  240  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  62.11 
 
 
951 aa  236  1e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  59.9 
 
 
490 aa  236  2e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  56.59 
 
 
501 aa  231  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  53.95 
 
 
524 aa  229  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.84 
 
 
858 aa  226  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 
781 aa  225  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  54.98 
 
 
509 aa  224  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.76 
 
 
824 aa  223  1e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.04 
 
 
781 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.33 
 
 
785 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  5.09357e-07 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.47 
 
 
894 aa  212  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  54.38 
 
 
535 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.22 
 
 
848 aa  204  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.93 
 
 
763 aa  198  5e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.47 
 
 
717 aa  188  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  49.09 
 
 
533 aa  186  2e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.78 
 
 
1171 aa  184  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  38.74 
 
 
233 aa  184  8e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.02 
 
 
913 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  48.77 
 
 
837 aa  179  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  45.5 
 
 
683 aa  178  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.93 
 
 
748 aa  174  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.8 
 
 
747 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 
766 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 
754 aa  170  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 
803 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  46 
 
 
679 aa  167  6e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  32.11 
 
 
1108 aa  166  1e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 
1175 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  31.41 
 
 
1019 aa  162  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  43.86 
 
 
309 aa  158  5e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.08 
 
 
686 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.06 
 
 
1289 aa  157  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  28.44 
 
 
1044 aa  154  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  29.31 
 
 
1035 aa  152  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 
951 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.38 
 
 
1033 aa  152  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  56.69 
 
 
912 aa  151  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  1.46968e-05 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.12 
 
 
1264 aa  150  9e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  9.54733e-05  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
987 aa  150  1e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.64 
 
 
972 aa  150  1e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.09 
 
 
630 aa  150  2e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.95 
 
 
1036 aa  149  2e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>